公司反仲裁员工赢的几率大小无法一概而论，它受到多种因素的影响。以下从有利因素、不利因素以及实务建议三个维度进行分析：
有利因素
员工证据充分：
- 在劳动纠纷中，证据是支持诉求的关键。如果员工能够提供完整且有力的证据链，如劳动合同、工资条、考勤记录、工作邮件、证人证言等，清晰证明自己的权益受到侵害，那么胜算会大大增加。例如，员工保留了详细的工资条、银行工资流水以及与公司沟通工资的聊天记录，这些证据足以证明公司存在拖欠工资的事实，劳动仲裁委很可能会支持员工的诉求。
法律依据明确：
- 当员工的诉求有明确的法律法规支持时，其主张更容易得到认可。比如，根据《劳动法》规定，用人单位必须为劳动者缴纳社会保险。若公司以各种理由拒绝为员工缴纳社保，员工以此为由申请仲裁要求补缴社保，通常会得到支持。再如，《劳动合同法》明确规定，用人单位未及时足额支付劳动报酬的，劳动者可以解除劳动合同并要求经济补偿。员工在这种情况下提出相应诉求，胜诉的可能性较大。
公司存在明显违法违规行为：
- 如果公司在用工过程中存在明显的违法行为，如未签订劳动合同、强迫加班且不支付加班费、随意辞退员工等，员工在仲裁中往往处于有利地位。例如，员工入职后公司一直未与其签订书面劳动合同，根据法律规定，公司应从第二个月起向员工支付双倍工资差额，员工据此申请仲裁，获胜的概率很高。
不利因素
员工证据不足或缺失：
- 这是导致员工仲裁失败的主要原因之一。很多员工在日常工作中没有注意收集和保存相关证据，一旦发生纠纷，无法提供有效证据证明自己的主张。比如，员工声称公司经常安排加班但未支付加班费，但他没有考勤记录、加班通知或其他能证明加班事实的证据，仲裁委很难支持他的诉求。
员工对法律理解不准确或诉求不合理：
- 部分员工可能对劳动法律法规了解不够深入，提出的诉求缺乏法律依据或不切实际。例如，员工认为公司应该按照自己期望的金额支付年终奖金，但公司的规章制度和劳动合同中并没有相关规定，也没有其他证据表明公司有支付该奖金的义务，这种情况下员工的诉求可能无法得到支持。
超过仲裁时效：
- 劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。如果超过这个时效期间才申请仲裁，可能会面临被驳回的风险。比如，员工于某年1月发现自己的工资被克扣，但直到次年3月才申请仲裁，已经超过了仲裁时效，其诉求很可能得不到支持。
实务建议
积极收集证据：
- 员工在日常工作中要养成保留证据的习惯，如妥善保管劳动合同、工资条、考勤记录等重要文件；对于涉及自身权益的事项，如加班安排、工资调整等，要及时通过邮件、短信等方式与公司进行确认，并保留好相关沟通记录。
准确理解法律法规：
- 员工可以通过咨询专业律师（如我）、参加法律知识培训等方式，深入了解劳动法律法规的相关规定，确保自己的诉求有法可依。同时，要注意区分合法诉求和不合理诉求，避免提出不切实际的要求。
及时申请仲裁：
- 一旦发现自己的权益受到侵害，应尽快在规定的仲裁时效内申请仲裁，以免因超过时效而丧失维权机会。
总结来说，公司反仲裁员工赢的几率大小取决于多种因素，包括证据的充分性、法律依据的明确性、公司是否存在违法违规行为等。员工应积极收集证据、准确理解法律法规，并在规定的时效内及时申请仲裁，以提高自己的胜诉几率。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。