结论：电瓶车闯红灯被正常行驶车辆撞了，双方车坏了且没报警，双方自行协商承担责任是存在风险的，不建议这样做。以下从多个角度进行分析：

从法律责任认定的角度

1. 事故责任划分原则：在交通事故中，责任的划分主要依据各方的过错程度。电瓶车闯红灯明显违反了交通信号灯的规定，属于严重的交通违法行为，在事故中通常要承担主要责任甚至全部责任。而正常行驶的车辆如果没有其他违法行为，一般不承担责任或者承担次要责任。但具体的责任划分需要交警部门根据现场勘查、调查取证等情况来确定。
2. 自行协商的风险：如果双方自行协商承担责任，没有经过交警部门的认定，那么后续可能会出现责任认定不清的问题。例如，如果电瓶车车主在协商时承认自己全责，但事后又反悔，而正常行驶车辆的车主又没有足够的证据证明电瓶车闯红灯的事实，那么在后续的赔偿纠纷中，正常行驶车辆的车主可能会面临不利局面。

从保险理赔的角度

1. 保险理赔的依据：车辆保险理赔通常需要交警部门出具的事故责任认定书作为依据。如果双方没有报警，没有事故责任认定书，保险公司可能会拒绝理赔或者要求双方提供其他充分的证据来证明事故责任。
2. 自行协商对理赔的影响：即使双方自行协商达成了责任承担的协议，但保险公司可能不会认可这种私下协议。因为保险公司需要按照法定的程序和标准来确定赔偿责任和赔偿金额。如果双方自行协商的结果与保险公司根据实际情况认定的责任和赔偿金额不一致，那么保险公司可能会按照自己认定的结果进行理赔，这可能会导致双方在理赔过程中产生纠纷。

从后续纠纷处理的角度

1. 纠纷产生的可能性：交通事故往往伴随着人员伤亡和财产损失，即使当时双方看起来没有异议，但事后可能会出现各种纠纷。例如，电瓶车车主可能在事后发现自己的伤势比当时认为的更严重，或者车辆损坏的维修费用比预期的更高，从而要求正常行驶车辆的车主承担更多的赔偿责任。
2. 缺乏证据的困境：如果没有报警，现场的证据可能无法得到及时的固定和保存。例如，现场的监控录像可能会被覆盖，目击证人可能会忘记事故的细节等。这会导致在后续的纠纷处理中，双方都缺乏足够的证据来支持自己的主张，使得纠纷难以得到公正、合理的解决。

建议：

1. 立即报警：无论事故的严重程度如何，都应该立即报警，让交警部门到现场进行勘查和调查，出具事故责任认定书。这样可以明确各方的责任，为后续的保险理赔和纠纷处理提供依据。
2. 保留证据：在等待交警到来的过程中，双方可以尽量保留现场的证据，如拍照、录像等，记录事故现场的情况、车辆损坏的部位等。同时，记录目击证人的联系方式，以便后续需要时能够联系到他们。
3. 及时通知保险公司：在报警的同时，双方都应该及时通知自己的保险公司，告知事故的发生情况，并按照保险公司的要求提供相关的资料和证据，以便保险公司能够及时进行理赔。

如果你在交通事故责任认定、保险理赔等方面还有其他问题，可以直接向我咨询。