结论：聊天软件违法所得6000元是否会被起诉，不能一概而论，需结合具体违法情形、行为性质、社会危害程度以及相关法律规定综合判断。以下从不同角度进行分析：

一、违法所得与刑事立案标准的关系

1. 一般原则：违法所得是衡量违法行为社会危害性的重要指标之一，但并非唯一标准。刑事立案需同时考虑行为性质、情节严重程度、是否造成实际损害等因素。

2. 具体情形：

   • 若涉及诈骗、传播淫秽物品牟利等犯罪：根据《刑法》及相关司法解释，诈骗罪的立案标准通常为3000元至1万元以上（各地标准可能不同），传播淫秽物品牟利罪的立案标准为违法所得1万元以上或传播淫秽物品200件以上等。若违法所得6000元且符合其他构成要件，可能构成犯罪并被起诉。
   • 若涉及非法经营、侵犯知识产权等犯罪：需结合具体罪名和立案标准判断。例如，非法经营罪的立案标准通常较高，需达到一定经营数额或违法所得数额。
   • 若仅违反治安管理处罚法：如传播淫秽信息但未牟利，或情节轻微的其他违法行为，可能仅面临行政处罚（如罚款、拘留），不会被刑事起诉。

二、社会危害性与起诉必要性

1. 社会危害性：即使违法所得未达到刑事立案标准，若行为性质恶劣（如组织、策划严重违法活动）、社会影响恶劣（如引发群体性事件），仍可能被追究刑事责任。

2. 起诉必要性：检察机关在决定是否起诉时，会综合考量犯罪情节、被告人认罪态度、社会危害性等因素。若违法所得6000元但情节轻微、认罪态度好，可能作出不起诉决定或建议法院从轻处罚。

三、法律建议

1. 立即停止违法行为：若涉及违法活动，应立即停止并消除影响，避免进一步扩大法律风险。

2. 主动配合调查：若已被公安机关立案侦查，应如实陈述事实、配合调查，争取从宽处理。

3. 咨询专业律师：针对具体案情，建议直接向我咨询，以便更准确地评估法律风险并制定应对策略。

四、可能后果

1. 刑事责任：若构成犯罪，可能面临有期徒刑、拘役、罚金等刑罚。具体刑期需结合罪名、情节等因素确定。

2. 行政责任：若不构成犯罪，可能面临行政处罚（如罚款、拘留），并需退缴违法所得。

3. 民事责任：若违法行为给他人造成损害，还需承担民事赔偿责任。

总结：聊天软件违法所得6000元是否会被起诉，需结合具体违法情形和法律规定综合判断。建议立即停止违法行为，并咨询专业律师以准确评估法律风险。