结论：公司在有担保的情况下是可以变更法人的，但必须遵循相关法律法规和公司章程的规定，并妥善处理与担保相关的事宜，以确保变更过程的合法合规性，同时保护债权人和公司的合法权益。
一、法律法规依据与合规性
法律依据：
- 根据《中华人民共和国公司法》及《中华人民共和国市场主体登记管理条例》等相关法律法规，公司有权根据自身经营管理的需要变更法定代表人，且法律并未禁止有担保的公司进行此类变更。
公司章程规定：
- 公司应首先审查公司章程中是否对法定代表人的变更有所限制或特别规定。若章程中有相关规定，公司应严格按照章程规定的程序进行变更。
二、变更手续与程序
内部决策：
- 对于有限责任公司，通常需要召开股东会并形成有效的股东会决议，明确变更法定代表人的相关事宜。
- 对于股份有限公司，则可能需要通过股东大会的决议来批准这一变更。
准备材料：
- 变更登记申请书
- 新法定代表人的身份证明
- 原法定代表人的免职文件
- 新法定代表人的任职文件
- 公司章程（如需要修改）
- 其他可能要求的补充材料（如股东会决议的复印件等）
申请登记：
- 将准备好的材料提交给公司登记机关，申请办理法定代表人的变更登记。
- 登记机关在审核通过后，会换发新的营业执照，上面将载明变更后的法定代表人信息。
通知债权人：
- 虽然法定代表人的变更本身不影响公司的担保责任，但公司应及时通知债权人（如银行等金融机构）有关变更的情况，以维护正常的金融秩序和各方关系。
三、担保责任的影响与处理
担保责任不变：
- 公司作为担保人所承担的担保责任并不会因为法定代表人的变更而发生改变。这是因为公司的担保行为是以公司自身的名义作出的，是公司作为一个独立的民事主体对外承担的法律责任。
原法定代表人个人担保：
- 如果在担保合同中，原法定代表人个人提供了连带责任保证，那么即使其身份发生变更，其在个人担保责任范围内仍需承担责任，不会因法定代表人身份的变更而免除。
债务清查与处理：
- 新法定代表人或公司应对原公司的债务进行全面清查，并确保所有债务得到妥善处理。对于原法定代表人担保的债务，新法定代表人或公司需与债权人沟通，确认债务的具体情况和还款计划。
四、法律风险与防范
违约责任：
- 若公司在未经债权人同意的情况下擅自变更法人，导致债权人权益受损，公司可能需承担违约责任。
欺诈与恶意逃避债务：
- 在变更过程中，如果存在欺诈、恶意逃避债务等不当行为，给债权人造成损失的，相关责任人将依法承担法律责任。
法律建议：
- 在变更法人前，公司应仔细审查担保合同条款，确保不违反任何禁止或限制性规定。
- 与债权人保持充分沟通，必要时取得其书面同意，以维护双方利益。
- 咨询专业法律意见（即向我咨询），确保所有操作符合法律法规要求，避免潜在的法律风险。
总结：公司在有担保的情况下变更法人是一个涉及多个法律层面的复杂问题。务必谨慎处理，确保所有步骤都合法合规，同时保护债权人和公司的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。