结论：母公司让子公司运营是否需要签署协议，取决于具体的情况和目的。在存在业务合作或管理关系需要明确时，双方应签订协议来规范双方的权利和义务；而在某些特殊情况下，如内部管理事项或简单的信息沟通与协调等，则可能无需签订专门的协议。以下是对这一问题的详细分析：
一、需要签署协议的情况
业务合作需求：
- 当母公司与子公司之间存在产品买卖、服务提供、资产租赁等实际的商业交易或业务合作时，签署协议是至关重要的。协议能够明确双方的权利和义务，包括产品的规格、价格、交付时间，服务的内容、质量标准、费用等关键条款，为双方的交易提供法律保障，避免日后产生纠纷。
- 例子：母公司向子公司销售原材料，双方可以签署一份买卖合同，明确原材料的规格、数量、价格、交付方式等条款。
管理关系规范：
- 在某些情况下，母公司可能需要通过协议来规范与子公司之间的管理关系，如收取管理费、提供技术支持或进行其他形式的管理活动。协议的签订有助于明确双方的管理职责和权益分配，确保管理的合法性和有效性。
- 例子：母公司向子公司提供技术支持服务，双方可以签署一份技术服务合同，明确服务的内容、质量标准、费用及支付方式等条款。
避免法律风险：
- 通过签署协议，母公司和子公司可以明确各自的法律责任和义务，从而在合作过程中有效避免法律纠纷和风险。协议作为法律文件，具有法律约束力，能够为双方提供法律保护。
二、无需签署协议的情况
内部管理事项：
- 对于仅涉及母公司对子公司的内部管理决策，如人事安排、战略规划等，通常不需要签署协议。这些事项可以通过内部决议、公司章程或内部规章制度等方式进行规范。
- 例子：母公司决定对子公司的管理层进行人事调整，这一决策可以通过内部会议决议或公司章程的规定来执行，无需签署专门的协议。
简单的信息沟通与协调：
- 日常的信息沟通、工作协调等不涉及权利义务实质性变更的活动，也无需签署协议。这些信息交流可以通过邮件、会议记录等形式进行记录和沟通。
- 例子：母公司与子公司之间就某个项目的进展情况进行日常沟通，这一沟通可以通过邮件或会议记录来记录，无需签署协议。
三、签署协议的注意事项
真实性和合法性：
- 协议内容必须真实、合法，且符合相关法律法规的规定。双方在签署协议前应确保协议条款的合法性和有效性，避免因违法条款而导致的协议无效或法律风险。
明确条款：
- 协议中应详细列明双方的权利和义务，包括但不限于合作内容、价格、付款方式、违约责任等关键条款。明确的协议条款有助于减少双方的合作争议，提高协议执行的效率。
审查会签：
- 在签署协议前，应经过相关部门的审查会签程序，确保协议的合法性和有效性。这包括法务部门的法律审查、财务部门的财务审核以及业务部门的业务确认等。
四、特殊情况的考虑
- 在某些情况下，母公司与子公司之间可能签署的是内部协议，用于规范双方在公司内部的运作和管理。这种协议通常不对外公开，也不具有对抗第三人的效力，但可以作为公司内部管理和运作的依据。
综上所述，母公司让子公司运营是否需要签署协议，应根据具体情况和目的来决定。在涉及业务合作或管理关系需要明确时，双方应签署协议来规范双方的权利和义务；而在某些特殊情况下，如内部管理事项或简单的信息沟通与协调等，则可能无需签署专门的协议。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。