当用人单位与员工协商解除劳动合同但员工不同意时，用人单位应当冷静应对、依法处理。以下是从多个角度为你提供的详细分析和建议：
一、深入了解员工不同意的原因
首先，用人单位应与员工进行深入的沟通交流，了解其不同意解除劳动合同的具体原因。这些原因可能包括：
- 经济补偿不满：员工可能认为用人单位提出的补偿方案不足以弥补其因解除劳动合同而遭受的损失，如补偿金额过低、支付方式不合理等。
- 职业发展担忧：员工可能对离职后的就业前景感到不安，特别是对于那些在特定行业或企业工作时间较长、技能相对单一的员工。
- 对解除程序的疑虑：员工可能对协商解除劳动合同的流程和相关法律规定不了解，担心自身权益受损，如社保、公积金的处理方式，档案转移等手续。
二、针对性沟通与调整方案
针对员工提出的不同原因，用人单位应采取针对性的措施进行沟通和方案调整：
经济补偿调整：
- 在法律允许的范围内，重新审视补偿方案，考虑提高补偿金额、提供额外的福利（如职业培训机会、推荐就业等）或灵活的支付方式，以增强方案的吸引力。
- 注意：避免无原则地满足员工的过高要求，以免引发其他员工的效仿或给企业带来不必要的经济负担。
职业发展支持：
- 为员工提供职业指导和培训资源，帮助其提升就业竞争力。
- 考虑在解除劳动合同后以兼职、顾问等形式继续合作，减轻员工的职业担忧。
详细解释解除程序：
- 耐心向员工解释整个解除流程，包括社保、公积金的处理方式，档案转移等手续。
- 提供相关法律法规的说明，明确告知员工其权益和义务，消除员工的疑虑。
三、严格遵循法律规定
若经过深入沟通和方案调整，双方仍无法达成一致，用人单位必须严格遵守法律法规的规定行事：
员工无过错情况：
- 在劳动合同期限内且不存在法定解除情形时，用人单位不得单方面强行解除劳动合同。
- 法律依据：根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位违法解除劳动合同的，需承担支付赔偿金等法律责任。赔偿金的标准为经济补偿标准的二倍。
员工存在过错情况：
- 若员工存在严重违反规章制度、失职、营私舞弊等法定过错情形，用人单位可依据法律规定履行法定程序后解除劳动合同，且无需支付经济补偿。
- 注意：此过程需确保有充分证据支持，并且相关规章制度已向员工公示告知。否则，可能构成违法解除劳动合同。
四、合法途径解决争议
若双方无法通过协商解决问题，用人单位可考虑通过以下合法途径来解决争议：
劳动争议调解：
- 用人单位可以寻求劳动争议调解委员会的帮助进行调解。调解委员会将组织双方进行协商，寻求达成一致意见。
劳动仲裁：
- 若调解无果，用人单位或员工可以在规定时效内（一般为一年）向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 仲裁委员会将安排庭审，双方需陈述事实、出示证据，并对对方的观点和证据进行质证和反驳。
- 仲裁委员会将根据双方提供的证据和庭审情况作出裁决。
诉讼：
- 若对仲裁结果不满意，用人单位或员工可以在规定期限内（一般为收到仲裁裁决书之日起十五日内）向人民法院提起诉讼。
- 法院将进行审理并作出判决。判决具有法律效力，双方必须履行。
五、实际操作中的建议
- 保留证据：在整个处理过程中，用人单位应妥善保留与员工的沟通记录、补偿方案、规章制度等相关证据，以备后续维权之需。
- 遵循法定程序：用人单位在解除劳动合同时，必须遵循法定程序，如提前通知工会（如有）、给予经济补偿（如适用）等。
- 注重沟通方式：在与员工沟通时，用人单位应保持冷静、理性，避免情绪化或激化矛盾。同时，应尊重员工的意愿和权益，寻求双方都能接受的解决方案。
综上所述，当用人单位与员工协商解除劳动合同但员工不同意时，用人单位应深入了解员工不同意的原因、针对性沟通与调整方案、严格遵循法律规定，并通过合法途径解决争议。在整个处理过程中，用人单位应始终秉持自愿、平等的原则，确保双方的合法权益得到妥善保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。