结论：分公司签订的合同，在发生纠纷时，能否以总公司名义起诉需根据具体情况判断。一般情况下，若分公司有独立财产且足以承担责任，可先起诉分公司；若分公司财产不足以承担责任或合同有明确约定，则可将总公司列为共同被告或直接以总公司名义起诉。以下从不同角度详细分析：

一、分公司与总公司的法律关系

根据《中华人民共和国公司法》第十四条第一款规定，分公司不具有法人资格，其民事责任由总公司承担。这意味着，在法律上，总公司对分公司的行为负有最终责任。分公司作为总公司的分支机构，虽然可以独立参与民事活动，但其民事责任的最终承担者仍是总公司。

二、合同的相对性原理与分公司的独立诉讼地位

合同是相对人之间设立、变更、终止民事法律关系的协议。根据合同的相对性原理，分公司作为合同的直接当事人，应当独立承担由此产生的民事责任。然而，分公司虽不具有法人资格，但它是总公司依法设立并领取营业执照的分支机构，有一定的组织机构和财产，具备一定的独立参与民事活动的能力。因此，在发生合同纠纷时，分公司通常具有独立的诉讼地位，可以作为民事诉讼的当事人。

三、起诉对象的选择

1. 一般情况：

   • 当分公司有相对独立的财产且足以承担合同责任时，债权人可以仅起诉分公司，要求其独立承担责任。这是因为分公司作为合同的直接当事人，应当首先承担由此产生的民事责任。

2. 特殊情况：

   • 分公司财产不足以承担责任：若分公司的财产不足以承担全部责任，根据《中华人民共和国民法典》第七十四条的规定，债权人可以在起诉分公司的同时将总公司列为共同被告，要求总公司对分公司不足部分承担补充清偿责任。
   • 合同有明确约定：若合同中明确约定了在某些情况下可以向总公司追究责任，如分公司未经授权或超出授权范围签订合同，且该合同需经总公司追认后方有效，那么债权人在起诉时也可以将总公司列为共同被告。
   • 执行程序中的追加：在执行程序中，如果分公司不能清偿法律文书确定的债务，根据《最高人民法院关于民事执行中变更、追加当事人若干问题的规定》，可以追加法人总公司为被执行人。这意味着，在执行阶段，债权人也可以直接以总公司为被执行人进行申请。

四、实际操作中的注意事项

1. 证据收集：

   • 在准备起诉时，需要收集能够证明分公司与总公司关系的证据，如分公司的营业执照（显示隶属总公司）、总公司对分公司的授权文件、财务往来记录等。这些证据有助于明确责任主体，确保诉讼的顺利进行。

2. 管辖法院：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。在确定起诉对象时，要注意选择有管辖权的法院提起诉讼，以确保诉讼的合法性和有效性。

3. 诉讼策略：

   • 在实际操作中，可以根据具体情况选择起诉对象。如果分公司财产不足以承担责任或无法有效执行，将总公司和分公司一并列为被告是更为稳妥的选择。这可以保障后期的执行和债权人的权益，避免因分公司财产不足而导致的执行困难。

五、案例分析

假设某分公司与一家供应商签订了一份采购合同，但因经营不善导致无法按时支付货款。供应商在准备起诉时，发现分公司的财产不足以支付全部货款。此时，供应商可以选择将分公司和总公司一并列为被告，要求分公司承担独立责任，同时要求总公司对分公司不足部分承担补充清偿责任。这样，供应商可以更有效地维护自己的权益，确保货款的回收。

总结与建议：在与分公司签订合同后发生纠纷时，应综合考虑分公司的财产状况、合同的具体内容以及相关法律法规的规定来确定起诉对象。一般情况下优先考虑向分公司提起诉讼；但在特定情况下，如需要总公司承担补充清偿责任或合同有明确约定时，可同时将总公司列为共同被告或直接以总公司名义起诉。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。