法院冻结银行卡两年，在符合法定程序和条件的情况下，是合法的。以下从不同角度为您详细分析：
一、冻结期限的法律依据
一般规定：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，法院在采取保全措施或执行措施时，可以冻结被执行人的银行账户。但具体的冻结期限，法律并未直接规定一个固定的上限，而是根据案件的具体情况和需要来决定。
特殊案件的延长：
- 在涉及刑事犯罪的侦查、起诉、审判过程中，如果案件复杂或需要进一步调查，司法机关可以依法延长冻结期限。例如，在贪污贿赂、洗钱等犯罪案件中，为防止犯罪嫌疑人转移、隐匿违法所得，司法机关可能会直接冻结其银行卡，并且冻结期限可能达到两年或更久。
- 此外，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百四十四条的规定，公安机关在侦查犯罪过程中，若发现涉案资金可能涉及洗钱、诈骗等违法犯罪活动，可依法对嫌疑人的银行账户采取冻结措施。冻结期限通常不超过6个月，但案件复杂或需进一步调查时，经法定程序审批后可延长至1年甚至更久，实践中部分重大经济犯罪案件的冻结期限可能达到2年。虽然这是针对公安机关的规定，但法院在类似情况下也可能参照执行。
二、冻结程序的合法性
立案与审批：
- 法院在冻结银行卡前，必须已经立案，并且确认账户资金与案件存在关联。冻结期限的延长也需要经过法定程序的审批，不能随意为之。
通知义务：
- 法院在冻结银行卡后，应当及时通知当事人，告知其冻结的原因、期限等相关事项。这是保障当事人知情权的重要环节。如果法院未履行通知义务，当事人有权提出异议。
三、用户应对措施与建议
主动联系：
- 如果您发现自己的银行卡被冻结，且冻结期限较长（如两年），建议尽快向办案机关（如法院或公安机关）了解冻结原因及解冻流程。
法律救济：
- 如果您认为冻结行为存在错误或不合理之处，可以根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，向负责执行的人民法院提出书面异议。此外，您还有权通过申诉、上诉等合法途径来维护自己的权益。
配合调查：
- 在调查过程中，您应积极配合办案机关的工作，提供证据证明资金来源的合法性，以协助排除涉案嫌疑。
四、冻结期间的影响与注意事项
资金影响：
- 冻结期内，账户内资金无法支取或转账，但多数银行仍会正常计息。具体计息方式需咨询开户行。
信用记录：
- 因司法冻结导致的账户异常不会直接影响个人征信。但如果因冻结导致贷款还款失败，可能产生逾期记录，进而影响信用。
风险防范：
- 为避免类似情况再次发生，建议您保留交易流水、合同等材料以证明资金合法来源，并定期查询账户状态。
总结与建议：法院冻结银行卡两年，在符合法定程序和条件的情况下是合法的。如果您遇到此类情况，建议保持冷静，第一时间联系办案机关了解情况，并整理资金流向证明材料积极配合调查。如有必要，可寻求法律援助以确保自身合法权益不受侵害。如果您还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。