法院查封被执行人银行卡两年是合法的。以下是对此问题的详细分析：

一. 法律依据

1. 《中华人民共和国民事诉讼法》第二百四十九条：被执行人未按执行通知履行法律文书确定的义务，人民法院有权向有关单位查询被执行人的存款、债券、股票、基金份额等财产情况。人民法院有权根据不同情形扣押、冻结、划拨、变价被执行人的财产。人民法院查询、扣押、冻结、划拨、变价的财产不得超出被执行人应当履行义务的范围。

2. 《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》第二十九条：人民法院冻结被执行人的银行存款及其他资金的期限不得超过六个月，查封、扣押动产的期限不得超过一年，查封不动产、冻结其他财产权的期限不得超过二年。法律、司法解释另有规定的除外。申请执行人申请延长期限的，人民法院应当在查封、扣押、冻结期限届满前办理续行查封、扣押、冻结手续，续行期限不得超过前款规定期限的二分之一。

二. 分析说明

• 根据上述法律规定，人民法院在执行过程中，有权对被执行人的财产采取查封、冻结等措施。对于银行存款的冻结，期限不得超过六个月，但可以续行冻结。
• 对于其他财产的查封、扣押、冻结，包括银行卡，期限不得超过二年。这也意味着，法院查封被执行人银行卡两年的行为，在法律规定的期限内，是合法的。

三. 特殊情况

• 如果查封、冻结期限届满，而案件尚未执行完毕，申请执行人可以申请续行查封、冻结，但续行期限不得超过原定期限的二分之一。

我的观点：法院查封被执行人银行卡两年的行为，在法律规定的期限内，是合法的。这是法院在执行过程中的一种常见措施，旨在保障申请执行人的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。