结论：银行是否会退还已扣的工资，取决于多个因素，包括担保合同的具体条款、债务人的还款情况、银行的扣款行为是否合法合规等。以下从不同角度进行分析：
一、担保合同与扣款行为
担保合同条款：
- 首先，需要仔细审查您与债权人（如银行）签订的担保合同。合同中应明确约定了担保的范围、方式、期限以及担保人的权利和义务等。
- 如果合同中明确规定了，在债务人未按时还款时，银行有权从您的账户中扣款以偿还债务，并且这种扣款行为符合合同约定和法律规定，那么银行扣款的行为可能是合法的。
扣款行为的合法性：
- 即使担保合同中有相关约定，银行的扣款行为也必须符合法律法规的规定。例如，银行不能随意扩大扣款范围或金额，必须按照合同约定的方式和金额进行扣款。
- 如果银行的扣款行为存在违法或违规情况，如未经您同意擅自扣款、扣款金额超过合同约定等，您有权向银行提出异议，并要求银行退还多扣的款项。
二、债务人还款情况
债务人已按时还款：
- 如果债务人已经按时偿还了债务，那么银行就没有理由再从您的账户中扣款。在这种情况下，如果银行仍然扣款，您有权要求银行立即退还已扣的款项，并可以向银行提出投诉或寻求法律救济。
债务人未按时还款但您已代偿：
- 如果债务人未按时还款，但您已经按照担保合同的约定代为偿还了债务，那么您也有权要求银行退还已扣的款项（如果银行已经扣款的话）。因为此时债务已经得到清偿，银行没有理由再保留您的款项。
三、法律救济途径
与银行协商：
- 在发现银行扣款行为存在问题时，您首先可以尝试与银行进行协商，要求银行退还已扣的款项并解释扣款原因。
向监管部门投诉：
- 如果协商无果，您可以向银行的监管部门（如中国银行保险监督管理委员会）进行投诉，要求监管部门介入调查并处理。
寻求法律救济：
- 如果以上途径均无法解决问题，您还可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。例如，您可以向法院提起诉讼，要求银行退还已扣的款项并赔偿因此造成的损失。
四、建议与注意事项
保留相关证据：
- 在处理此类问题时，建议您保留好所有与担保合同、债务人还款情况以及银行扣款行为相关的证据材料，如合同文本、还款记录、扣款通知等。这些证据将有助于您在协商、投诉或诉讼过程中维护自己的权益。
及时咨询专业律师：
- 由于此类问题涉及复杂的法律关系和专业知识，建议您在处理过程中及时咨询专业律师的意见。律师可以根据您的具体情况提供针对性的法律建议和帮助。
最后，银行是否会退还已扣的工资取决于多个因素的综合考量。如果您对此类问题存在疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。