在机动车挂靠经营发生事故的情况下，赔偿责任的承担需根据具体情况和相关法律规定来确定，一般由挂靠人和被挂靠人承担连带责任。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情形下的连带责任
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一千二百一十一条的规定，以挂靠形式从事道路运输经营活动的机动车，发生交通事故造成损害，且属于该机动车一方责任的，由挂靠人和被挂靠人承担连带责任。
- 《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第三条也进一步明确了这一点，规定当事人可以请求挂靠人和被挂靠人承担连带责任，人民法院应予支持。
法律解释：
- 被挂靠单位因收取管理费用并允许挂靠人以其名义运营，应对经营活动进行管理和监督，对可能产生的风险负责。连带责任有助于保障受害人获得充分赔偿，并促使被挂靠单位加强车辆管理。
实例说明：
- 如甲将货车挂靠在乙运输公司名下，因操作不当与丙车碰撞，甲负全责，则丙可要求甲和乙运输公司承担连带赔偿责任。
二、内部责任划分与追偿
内部责任划分：
- 挂靠人作为车辆的实际经营者和使用者，对车辆的运行和管理具有直接的控制权，因此通常应承担主要的赔偿责任。
- 被挂靠人若收取管理费或获得其他经济利益，应在收益范围内承担相应的赔偿责任，并需对挂靠车辆的运营进行一定的管理和监督。若未尽到管理监督义务，如资质审查不严、安全管理疏忽等，导致事故发生，被挂靠人也需承担相应的赔偿责任。
追偿权利：
- 被挂靠人在承担责任后，可依据与挂靠人的约定或其他法律规定向挂靠人追偿部分损失。但这不影响其对外承担的连带赔偿责任。
三、保险公司的赔偿顺序
交强险赔偿：
- 首先由承保交强险的保险公司在责任限额范围内对受害人进行赔偿。
商业三者险赔偿：
- 交强险赔偿不足的部分，由承保商业三者险的保险公司根据保险合同的约定进行赔偿。
挂靠人与被挂靠人连带赔偿：
- 若经过交强险和商业三者险的赔偿后，仍有剩余损失未得到赔偿，则由挂靠人和被挂靠人共同承担连带赔偿责任。
四、特殊情况下的责任认定
未收取管理费的情况：
- 若被挂靠单位未收取管理费等经济利益，仅为形式上的挂靠，且对车辆未实际管理，在保险赔偿超出交强险限额的部分，需根据挂靠协议等相关约定确定赔偿责任主体。这种情况下，被挂靠单位可能只需承担有限的补充责任而非连带责任。
协议约定：
- 如果挂靠人和被挂靠人之间有特殊的约定，比如双方约定被挂靠人对交通事故的后果免责等，那么在这种情况下，应按照双方的约定来处理赔偿责任的分担。但这种约定不能对抗外部受害人的赔偿请求，即挂靠人和被挂靠人仍需先对受害人承担连带责任，之后再根据内部约定进行责任分担。
总结与建议
对于机动车挂靠经营发生事故时的赔偿责任问题，应综合考虑挂靠关系、事故责任、侵权人情况、保险赔偿以及内部责任划分等多个因素来判断。无论何种情况，确保交通安全、遵守法律法规是公民和企业应尽的责任和义务。在实际操作中，建议各方明确权利义务关系，加强车辆管理，以降低事故风险和赔偿责任的发生。若遇到具体法律问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供有针对性的法律建议。