结论前置：若隔壁的违章建筑侵害了您的合法权益，您确实可以通过法院起诉来维护自己的权益。具体可以通过民事诉讼或行政诉讼两种途径进行，下面我将从这两个角度为您详细分析。
一、民事诉讼途径
适用情况：
- 当隔壁的违章建筑直接影响了您的通风、采光、通行等相邻权益时，您可以依据《中华人民共和国民法典》的相关规定，以相邻权受到侵害为由向法院提起民事诉讼。
法律依据：
- 《中华人民共和国民法典》第二百八十八条：不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。
- 《中华人民共和国民法典》第二百九十三条：建造建筑物，不得违反国家有关工程建设标准，不得妨碍相邻建筑物的通风、采光和日照。
起诉流程：
- 收集证据：拍摄违章建筑的外观、位置以及与您房屋的距离等照片和视频，以证明其对您相邻权的影响；准备房产证、土地证等相关文件，证明您对受影响的房屋或土地拥有合法权利；如有必要，可邀请邻居、物业管理人员或其他相关人员作为证人，提供关于违章建筑影响您生活的证言。
- 撰写起诉状：明确诉讼请求，如要求拆除违章建筑、赔偿损失等，并附上相关证据材料。
- 提交起诉：向有管辖权的人民法院递交起诉状及相关证据。
- 法院审理：法院受理后会进行审理，并根据事实与法律作出判决。
可能结果：
- 若法院认定违章建筑确实侵害了您的权益，会判决对方停止侵害、排除妨碍，甚至拆除违建部分，并可能要求对方赔偿因此给您造成的损失。
二、行政诉讼途径（附带民事诉讼）
适用情况：
- 当您向相关行政部门（如城市管理部门、城乡规划主管部门）举报隔壁的违章建筑行为，但行政部门未履行查处职责时，您可以针对行政部门的不作为向法院提起行政诉讼，并可同时要求违建者承担民事责任。
法律依据：
- 《中华人民共和国行政诉讼法》第十二条：人民法院受理公民、法人或者其他组织提起的下列诉讼，其中包括申请行政机关履行保护人身权、财产权等合法权益的法定职责，行政机关拒绝履行或者不予答复的情形。
起诉流程：
- 提出查处申请：向相关行政机关提出书面查处申请，并保留好申请证据。
- 等待行政机关处理：若行政机关在法定期限内不处理或处理结果不符合法律规定，则进入下一步。
- 撰写行政起诉状：明确诉讼请求，如要求行政机关履行查处职责，并附上相关证据材料。
- 提交起诉：向有管辖权的人民法院递交行政起诉状及相关证据。
- 法院审理：法院受理后会进行审理，并根据事实与法律作出判决。
可能结果：
- 法院可能判决行政部门履行职责，对违章建筑进行查处；同时，若您提出了民事赔偿请求，且法院认定违建者确实应承担民事责任，则可能判决违建者赔偿因此给您造成的损失。
操作建议
- 在采取行动前，建议您先尝试与邻居进行协商调解，寻求双方都能接受的解决方案，这有助于减少诉讼成本和时间，同时维护邻里关系。
- 无论是提起民事诉讼还是行政诉讼，都需要准备充分的证据材料来支持您的主张。因此，请务必重视证据的收集和保存工作。
- 若您对法律程序不熟悉或感到困惑，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律指导和建议。
综上所述，面对隔壁的违章建筑问题，您应根据具体情况选择合适的维权途径，并遵循相应的法律程序与规定，以确保您的合法权益得到有效保护。