公司违规使用他人资质申请项目是违法的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与违法性质
《中华人民共和国建筑法》的禁止性规定：
- 根据《中华人民共和国建筑法》第二十六条，承包建筑工程的单位应当持有依法取得的资质证书，并在其资质等级许可的业务范围内承揽工程。禁止建筑施工企业以任何形式允许其他单位或者个人使用本企业的资质证书、营业执照，以本企业的名义承揽工程。这一条款直接针对建筑行业中的资质借用行为，确立了其违法性。虽然用户问题未明确提及建筑行业，但此条款的精神可类比适用于其他需要资质认证的行业。
资质借用的普遍违法性：
- 资质借用行为不仅违反了建筑法的规定，还可能违反其他行业的相关法律法规。资质是公司从事特定业务活动的法定条件，违规使用他人资质申请项目，实质上是欺骗了项目审批机关和潜在合作伙伴，破坏了市场秩序和公平竞争环境。
民事法律层面的无效认定：
- 如果公司因违规使用他人资质而签订了相关合同，这些合同可能因违反法律强制性规定而被认定为无效。根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》等相关司法解释，无资质或借用资质签订的合同无效，这可能导致公司面临合同纠纷和法律责任。
二、实际案例与法律后果
行政处罚：
- 公司违规使用他人资质申请项目，一旦被发现，将面临行政处罚。处罚措施可能包括罚款、没收违法所得、责令停业整顿、降低资质等级或吊销资质证书等。这些处罚将对公司造成严重的经济损失和声誉损害。
刑事责任风险：
- 在某些情况下，违规使用他人资质申请项目可能构成犯罪。例如，如果公司通过欺骗手段获取项目，并因此造成重大损失或严重后果，相关责任人员可能面临刑事责任的追究。
民事赔偿：
- 如果公司因违规使用他人资质而给第三方造成损失，公司可能需要承担民事赔偿责任。这包括赔偿因项目失败或质量问题给客户造成的损失，以及因合同无效而产生的其他经济损失。
三、合规建议
严格资质管理：
- 公司应建立严格的资质管理制度，确保所有业务活动都在公司合法拥有的资质范围内进行。避免违规使用他人资质或出借本公司资质给其他单位或个人使用。
加强内部监控：
- 公司应加强内部监控机制，对项目申请、合同签订等关键环节进行严格审查。确保所有业务活动都符合法律法规和公司规章制度的要求。
提高法律意识：
- 公司应定期组织员工学习相关法律法规和规章制度，提高员工的法律意识和合规意识。确保员工在业务活动中能够自觉遵守法律法规和公司规章制度的要求。
及时咨询专业律师：
- 如果公司在业务活动中遇到法律问题或疑虑，应及时咨询专业律师的意见。律师能够提供专业的法律建议和指导，帮助公司规避法律风险并维护合法权益。
综上所述，公司违规使用他人资质申请项目是违法的，并可能面临严重的法律后果。因此，我建议公司严格遵守相关法律法规和规章制度的要求，确保所有业务活动都在合法合规的框架内进行。如有任何法律问题或疑虑，请直接向我咨询。