分居多年女方私自做试管移植是否违法，需根据具体情况来判断，主要看是否违反了夫妻间的忠诚义务或相关法律规定。以下是对此问题的详细分析：
一、婚姻关系存续期间的情况
法律义务与规定
- 在婚姻关系存续期间，夫妻双方负有互相忠实、互相尊重的义务，这是法律所明文规定的，也关乎道德层面。
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，禁止有配偶者与他人同居，这同样适用于试管移植等涉及生育的行为，如果该行为涉及与第三方的不正当关系，则可能违反此规定。
违法性分析
- 如果女方在分居期间，未经男方同意，私自使用与第三方（非丈夫）的精子进行试管移植，这可能构成对婚姻忠诚义务的违反，尤其是在如果这种行为被视为与第三方有同居或类似同居关系的情况下。
- 如果试管移植使用的是丈夫的精子，但未经其明确同意，也可能引发关于生育权、身体权等法律争议，尽管这不一定直接构成违法，但可能违反夫妻间的相互尊重和协商原则。
二、婚姻关系已解除或视为解除的情况
法律状态变化
- 如果双方已经正式离婚，或者虽然未办理离婚手续但已分居多年且感情破裂，婚姻关系在实际上已经解除，那么女方进行试管移植的行为通常不再受婚姻法的限制。
合法性确认
- 在婚姻关系已经解除或视为解除的情况下，女方有权自由选择自己的生育方式，包括试管移植，这不再受法律的限制或约束，但应遵守相关的医疗伦理和法律规定。
三、特殊情形下的法律考量
军婚的特殊保护
- 如果涉及军婚，即女方或男方为现役军人，那么需要特别注意《中华人民共和国刑法》中关于破坏军婚的规定。不过，这一规定主要针对的是与现役军人的配偶同居或结婚的行为，与试管移植的直接关联性不强，除非试管移植行为本身构成了与第三方的不正当关系。
试管移植的合法性与伦理
- 试管移植本身是一种合法的医疗手段，但必须遵守相关的医疗伦理和法律规定。例如，必须确保使用的精子或卵子来源合法，必须尊重患者的知情权和同意权等。
四、法律建议
沟通协商
- 在分居期间，如果双方对生育问题有分歧，应首先通过沟通协商来解决。这有助于避免不必要的法律纠纷和情感伤害。
寻求法律帮助
- 如果无法通过沟通协商解决问题，或者认为自己的权益受到了侵害，可以寻求专业的法律帮助。作为专业律师，我可以根据具体情况提供针对性的法律建议和解决方案。
总结来说，分居多年女方私自做试管移植是否违法，取决于多种因素，包括婚姻关系是否存续、试管移植的具体方式、是否涉及与第三方的不正当关系等。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。