政府购买服务是否按照合同扣费，需分情况讨论，核心结论如下：

1. 合同明确约定扣费条款时，政府需按合同执行
   若政府与服务提供方签订的合同中明确约定了服务费用、支付方式、扣费情形（如服务质量不达标、未完成约定任务等）及具体比例，则政府有权依据合同条款进行扣费。例如，合同约定“若服务方未按时提交报告，每次扣除合同总金额的5%”，此时扣费行为具有合法性。

2. 合同未约定或约定不明时，需结合法律规定处理
   若合同未对扣费作出约定，或约定模糊导致双方产生争议，则需依据《民法典》合同编的相关规定处理：

   • 协商补充：双方可协商补充扣费条款，或通过解释合同条款（如交易习惯、行业惯例）确定扣费规则；
     
   • 法定原则：若无法协商一致，政府扣费需符合“公平合理”原则，且需有充分证据证明扣费事由（如服务方违约行为）与扣费金额的关联性。例如，政府以“服务效果未达标”为由扣费，需提供第三方评估报告等证据支持。

3. 政府扣费需符合程序合法性要求
   即使合同约定了扣费条款，政府行使扣费权时仍需履行法定程序：

   • 通知义务：需提前书面告知服务方扣费事由、金额及依据；
     
   • 听证权利：若扣费金额较大或涉及重大利益，服务方有权要求听证或申辩；
     
   • 财政监管：扣费需符合财政预算、国库集中支付等规定，避免违规操作。

建议：

• 对服务提供方而言，签订合同时应明确扣费条款（如触发条件、计算方式、申诉途径），避免模糊表述；
  
• 对政府方而言，扣费需严格依据合同和法律，保留完整证据链，防范行政诉讼风险。
  

如有具体合同条款或争议场景，可进一步提供细节，我会为您分析法律风险及应对策略。