农业农村局行政执法晚上执法是否合法，需分情况讨论，具体如下：

1. 若符合法定程序且具备合法理由，晚上执法合法
   根据《行政处罚法》第三十七条，行政机关在调查或检查时，执法人员不得少于两人，并应出示执法证件。若农业农村局因案件特殊性（如涉及夜间作业的违法行为、证据易灭失等），需在夜间执法，且程序合法（如提前审批、全程记录等），则属于合法行为。例如，查处夜间非法捕捞、动物疫病防控等紧急情况，夜间执法具有合理性。

2. 若无合法理由或程序违法，晚上执法可能不合法
   若农业农村局未履行法定程序（如未出示证件、单人执法），或夜间执法缺乏必要性（如普通检查可在白天进行），则可能构成程序违法。此时，当事人有权拒绝配合，并可向上级部门投诉或申请行政复议。

建议：

• 若您遇到夜间执法，可要求执法人员出示证件并说明理由，同时记录执法过程（如拍照、录像）。
  
• 若认为执法行为违法，可保留证据并依法维权。
  

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