公司签合同中特别授权人签字后，公司不盖公章，合同的有效性并非绝对，而是需根据具体情况来判断。以下是对此问题的详细分析：
合同有效的情况
有特别授权人签字
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，若特别授权人获得了公司的明确授权，其签字即代表公司的真实意思表示。在这种情况下，即便合同未加盖公章，该合同仍可能被视为有效。因为特别授权人的签字已经构成了对公司行为的认可，且这种认可是基于公司的授权。
已实际履行合同义务
- 根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条：“当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。”如果合同虽未盖章，但一方当事人（如公司或合同相对方）已经实际履行了合同的主要义务，并且另一方也予以承认和接受，那么该合同同样成立并生效。这种实际履行行为能够弥补形式上的瑕疵，使合同产生法律效力。
合同无效的情况
- 若合同既没有加盖公章，也没有特别授权人的签字，且双方当事人也未实际履行合同义务，那么该合同在形式上存在明显瑕疵，可能无法被认定为有效合同。在此情况下，若发生纠纷，法院可能会认为合同未成立或无效。
法律建议
完善合同形式要件
- 为避免不必要的纠纷和风险，建议在签订合同时尽量完善合同的形式要件，如加盖公章、由法定代表人或特别授权人签字等。这些形式要件是合同有效性的重要保障，能够增强合同的证明力和执行力。
明确授权范围
- 如果公司选择由特别授权人签字而不盖公章，应确保特别授权人的授权范围明确且具体。授权书应详细列明特别授权人的权限范围、签字事项等，以避免因授权不明而产生的纠纷。
保留实际履行证据
- 如果合同在签订时未加盖公章或特别授权人签字，但双方已实际履行合同义务，应妥善保留相关证据，如履行凭证、对方接受凭证等。这些证据能够证明合同的实际履行情况，有助于在纠纷发生时维护自身权益。
总结：公司签合同中特别授权人签字后，公司不盖公章，合同的有效性需结合合同的具体内容、双方当事人的行为以及法律规定来综合判断。为确保合同的有效性，建议公司在签订合同时尽量完善形式要件，并明确授权范围、保留实际履行证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。