客运车辆拉载非法载运危险品的，一般由交通运输主管部门和公安机关进行处罚。具体分析如下：
交通运输主管部门的处罚：
- 法律依据：根据《中华人民共和国道路运输条例》的相关规定，客运经营者不得违反规定载运危险物品。若违反，交通运输主管部门有权责令改正，并处以罚款；情节严重的，还可能吊销其道路运输经营许可证。
- 处罚措施：具体罚款数额会根据违法情节的严重程度而定，一般包括警告、罚款等，罚款数额可能从数千元到数万元不等。若情节特别严重，如造成重大安全事故或严重社会影响，还可能面临更严厉的处罚，包括吊销经营许可证等。
公安机关的处罚：
- 法律依据：根据《中华人民共和国治安管理处罚法》和《中华人民共和国刑法》的相关规定，非法运输危险物质（包括危险品）是违法行为，若构成犯罪，将依法追究刑事责任；若尚不构成犯罪，则由公安机关给予治安管理处罚。
- 处罚措施：对于非法运输危险物质的行为，公安机关可以根据情节轻重，给予拘留、罚款等治安管理处罚。若行为构成犯罪，如非法运输爆炸物、剧毒化学品等，则可能面临有期徒刑、拘役或管制等刑事处罚。
特殊情况说明：
- 如果客运车辆驾驶员在不知情的情况下拉载了非法载运的危险品，且能够证明自己确实不知情，那么驾驶员可能不会受到处罚，但车辆所属单位或相关责任人仍可能因管理不善而受到处罚。
- 如果客运车辆驾驶员明知是危险品而故意拉载，那么驾驶员将直接面临法律的严惩，包括可能的刑事处罚。
建议与提醒：
- 客运车辆驾驶员和所属单位应严格遵守相关法律法规，不得拉载非法载运的危险品，以确保乘客和公共安全。
- 如果发现客运车辆拉载非法载运危险品的情况，应及时向交通运输主管部门或公安机关举报，以维护公共安全和社会秩序。
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