在分包工程中，总承包公司接管后续款项的责任归属问题，主要取决于总承包公司与分包单位之间的合同约定以及相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：
一、合同约定优先原则
合同明确约定：如果总承包公司与分包单位在合同中明确约定了后续款项的支付责任，包括支付条件、支付方式、支付时间等，那么双方应严格按照合同约定执行。例如，合同可能规定总承包公司在收到业主支付的款项后，再按照一定比例或时间节点支付给分包单位。
合同未明确约定：如果合同中没有明确约定后续款项的支付责任，或者约定不明确，那么双方应依据相关法律法规和行业惯例进行协商解决。在这种情况下，总承包公司可能因接管工程而承担一定的支付责任，但具体责任范围需根据实际情况和法律法规进行判断。
二、法律法规规定
《中华人民共和国民法典》相关规定：根据《民法典》中关于建设工程合同的规定，发包人（业主）与总承包人之间、总承包人与分包人之间均应签订书面合同，明确各自的权利和义务。如果总承包公司接管了分包工程，且该接管行为得到了业主的认可，那么总承包公司可能在一定程度上承担了原分包单位的部分或全部义务，包括后续款项的支付责任。但这一责任并非绝对，还需根据具体情况和合同约定进行判断。
行业惯例和公平原则：在建设工程领域，行业惯例和公平原则也是判断责任归属的重要依据。如果总承包公司接管了分包工程，且因此获得了相应的利益（如工程款的增加、工程进度的提前等），那么根据公平原则，总承包公司可能应承担一定的后续款项支付责任。
三、实际操作建议
审查合同条款：首先，应仔细审查总承包公司与分包单位之间的合同条款，特别是关于后续款项支付责任的约定。如果合同中有明确约定，则按照合同约定执行。
协商解决：如果合同中没有明确约定或约定不明确，双方应积极进行协商，寻求合理的解决方案。在协商过程中，可以参考相关法律法规和行业惯例，以及双方的实际情况和利益诉求。
寻求法律途径：如果协商无果，双方可以寻求法律途径解决争议。例如，可以向人民法院提起诉讼或申请仲裁机构进行仲裁。在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构将根据相关法律法规和合同约定进行裁决。
总结来说，分包工程总承包公司接管后续款项的责任归属问题并非一成不变，而是需要根据合同约定、法律法规规定以及实际情况进行综合判断。如果您在处理此类问题时遇到困惑或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。