在刑事案件中，若没有直接查明的客观事实，但存在相关证据，案件的处理会严格遵循“以事实为依据，以法律为准绳”的原则，这里的事实指的是法律事实，即通过证据来证明的事实。针对这一情况，我们可以从以下几个角度进行详细分析：
一、证据能否形成完整证据链
证据充分且形成完整证据链：
- 若现有证据能够充分证明案件中的待证事实，且证据之间、证据与案件事实之间不存在矛盾，足以排除其他可能性，那么法院会依据这些证据所证明的法律事实来作出裁判。
- 例如，在盗窃案件中，如果监控录像、目击者证言、指纹鉴定等证据能够相互印证，形成完整的证据链，证明被告人实施了盗窃行为，那么法院会据此认定被告人有罪。
证据不足或无法形成完整证据链：
- 若证据无法充分证明待证事实，如证据关联性不足、真实性存疑等，导致无法形成完整的证据链，那么法院可能不会支持控方的指控。
- 在这种情况下，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。
二、检察院的处理方式
不予起诉：
- 当刑事案件证据不足、事实不清时，检察院一般会作出不予起诉的决定。这是基于“疑罪从无”的原则，即在没有充分证据证明被告人有罪的情况下，不得对其定罪处罚。
- 例如，在某起故意伤害案件中，如果被害人陈述、证人证言等证据存在矛盾，且无法通过其他证据予以补强，导致无法确定被告人的犯罪行为，那么检察院可能会作出不予起诉的决定。
退回补充侦查：
- 在某些情况下，检察院可能会将案件退回公安机关进行补充侦查，以获取更多的证据来支持或反驳指控。
- 补充侦查的次数一般有限制，如果经过补充侦查后，证据仍然不足，检察院仍然会作出不予起诉的决定。
三、法律建议与后果
对于控方（检察院）：
- 在提起公诉前，应确保已经收集到充分、确实的证据来支持指控。如果证据不足，应及时进行补充侦查或考虑作出不起诉的决定。
- 避免因证据不足而导致案件被驳回或被告人被无罪释放，从而浪费司法资源并损害司法公信力。
对于辩方（被告人及其辩护人）：
- 应积极收集有利于被告人的证据，如无罪证据、罪轻证据等，以反驳控方的指控。
- 如果控方证据不足或存在矛盾，可以及时提出异议并要求法院不予采纳相关证据。
- 在案件处理过程中，应密切关注证据的收集和审查情况，确保被告人的合法权益得到保障。
若您在刑事案件中遇到证据不足或事实不清的情况，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。作为魏正才律师，我专注于合同纠纷、刑事辩护领域，能够为您提供专业、全面的法律服务。如果您有任何法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我提问。