工程挂靠合同在法律上是不合法的。以下是对这一结论的详细解释和分析：
一、法律依据
《中华人民共和国建筑法》第二十六条：
- 明确规定禁止建筑施工企业以任何形式允许其他单位或个人使用其资质证书、营业执照承揽工程。这一条款直接针对工程挂靠行为，表明法律对挂靠行为的明确禁止态度。
《中华人民共和国民法典》第七百九十一条：
- 规定承包人不得将其承包的全部建设工程转包给第三人或者将其承包的全部建设工程支解以后以分包的名义分别转包给第三人。同时，禁止承包人将工程分包给不具备相应资质条件的单位。这些规定间接限制了工程挂靠行为，因为挂靠往往涉及不具备资质的单位或个人通过借用资质来承揽工程。
《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第一条：
- 明确规定没有资质的实际施工人借用有资质的建筑施工企业名义签订的建设工程施工合同无效。这一司法解释直接确认了工程挂靠合同的无效性。
二、合同无效的原因
违反法律强制性规定：
- 工程挂靠合同违反了上述法律条款的强制性规定，这些规定是建筑市场秩序和公共利益的重要保障。因此，挂靠合同因违法而无效。
破坏市场公平竞争秩序：
- 挂靠行为使得不具备资质的单位或个人能够承揽工程，从而破坏了建筑市场的公平竞争秩序。这种不公平的竞争环境不利于建筑行业的健康发展。
工程质量难以保证：
- 挂靠行为往往导致实际施工人与合同签订主体不一致，使得工程质量难以得到有效保证。一旦发生质量问题，责任界定困难，容易引发社会问题。
三、法律后果
合同自始无效：
- 由于工程挂靠合同违反了法律的强制性规定，因此该合同自始无效。这意味着合同双方不能依据合同条款来主张权利或履行义务。
责任承担：
- 在工程挂靠合同无效的情况下，如果建设工程经竣工验收合格，实际施工人可以请求参照合同关于工程价款的约定折价补偿承包人。但如果建设工程经竣工验收不合格，且修复后仍不合格，承包人则无权请求折价补偿。此外，被挂靠企业可能需对建设工程质量承担连带责任，甚至面临吊销资质证书的严重后果。
刑事处罚风险：
- 如果挂靠行为严重扰乱市场秩序，情节严重时，相关责任人可能面临刑事处罚，如有期徒刑、拘役及罚金等。
四、实际操作建议
严格遵守法律法规：
- 施工企业应避免参与任何形式的挂靠行为，以免承担不必要的法律风险和经济损失。同时，发包方在选择承包商时，也应仔细审查其资质和信誉，确保工程质量和安全。
咨询专业律师：
- 在涉及工程挂靠等复杂法律问题时，建议咨询专业律师以获取准确的法律意见和指导。作为专业律师，我可以为你提供详细的法律咨询和辩护服务。
维护市场秩序和公共利益：
- 各方应共同维护建筑市场的正常秩序和公共利益，遵守法律法规的规定，促进建筑行业的健康发展。
综上所述，工程挂靠合同在法律上是不合法的，且可能带来严重的法律后果。因此，建议各方严格遵守法律法规，避免参与任何形式的挂靠行为。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。