结论：借5000还了1000逾期一年后需要还5500是否合法，取决于借款合同中约定的利率以及逾期利息的计算方式。若综合计算后的利息未超过法律规定的上限，则是合法的；反之，则不合法。

分析：

1. 借款本金与已还款项：

   • 借款本金为5000元。
   • 已还款项为1000元，剩余本金为4000元。

2. 利息计算：

   • 利息的计算需依据借款合同中的约定。若合同中有明确约定利率，则按照约定利率计算；若无明确约定，则可能需参照市场利率或法定利率。
   • 逾期利息的计算同样需依据合同约定或法律规定。通常，逾期利息会高于正常利息，以作为对借款人逾期还款的惩罚。

3. 合法性判断：

   • 根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》，借贷双方约定的利率未超过年利率24%（即月利率2%），出借人请求借款人按照约定的利率支付利息的，人民法院应予支持。
   • 若借贷双方约定的利率超过年利率36%（即月利率3%），超过部分的利息约定无效。借款人请求出借人返还已支付的超过年利率36%部分的利息的，人民法院应予支持。
   • 在本题中，若按照年利率24%计算，一年后的利息为\(4000 \times 24\% = 960\)（元）（仅计算剩余本金的利息）。若加上逾期利息（假设逾期利息与正常利息相同），总利息也不会轻易达到1500元（5500元-4000元本金）。因此，若实际要求偿还的5500元中，利息部分超过了按照法定利率计算得出的利息，则超出部分可能不合法。
   • 具体是否合法，还需看借款合同中的具体约定，包括利率、逾期利息的计算方式等。若合同中的约定符合法律规定，则要求偿还5500元可能是合法的；若合同中的约定违反了法律规定，则超出法定利率部分的利息要求是不合法的。

4. 建议：

   • 借款人应仔细审查借款合同中的条款，特别是关于利率和逾期利息的约定。
   • 若认为合同中的约定不合法或存在争议，借款人可以寻求法律帮助，如咨询律师或向相关机构投诉。
   • 在处理此类纠纷时，借款人应保留好相关证据，如借款合同、还款记录等，以便在需要时提供证明。

公式计算（假设以年利率24%为合法上限进行计算）：

• 剩余本金：4000元
• 一年合法利息：\(4000 \times 24\% = 960\)（元）
• 若要求偿还5500元，则其中利息部分为1500元，超过了合法利息960元，超出部分可能不合法。

进一步思考：

• 在实际操作中，除了利率和逾期利息的约定外，还需考虑其他可能影响合法性的因素，如借款合同是否有效、是否存在欺诈或胁迫等情形。
• 若借款人认为出借人的要求不合法，可以通过法律途径维护自己的权益，如提起诉讼或申请仲裁等。

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