在交通事故中，如果司机作为主要责任人不幸死亡，其赔偿问题确实相对复杂，涉及多个法律层面和实际操作流程。以下是对此类情况下赔偿事宜的详细解析：
一、明确赔偿责任与比例
根据《道路交通事故处理程序规定》，交通事故责任被细分为全部责任、主要责任、同等责任、次要责任和无责任。当司机被认定为主要责任人时，其承担的赔偿责任比例通常在60%至90%之间，具体比例需依据事故的实际情况，由交警部门在事故认定书中明确界定。这一比例是后续赔偿计算的基础。
二、赔偿主体及赔付流程
司机对他人的赔偿
- 赔偿主体：由于司机已死亡，其赔偿责任一般由司机的遗产继承人在所继承遗产的范围内承担。依据《民法典》的相关规定，继承人需在所得遗产实际价值范围内清偿被继承人依法应缴纳的税款和债务。若遗产不足以清偿全部债务，超出部分继承人无义务清偿，除非自愿。若继承人放弃继承，则对被继承人的债务可不负清偿责任。
- 赔付流程：首先，由保险公司在交强险责任限额内进行赔偿，包括死亡伤残赔偿、医疗费用赔偿及财产损失赔偿。超出交强险限额的部分，按事故责任比例，由司机的遗产继承人在遗产范围内进行赔偿。若司机还投保了商业第三者责任险，则超出交强险部分的赔偿可按保险合同约定由保险公司赔付；仍有不足部分，由其他责任人自行承担。
他人对司机的赔偿（即司机家属或遗产继承人可能获得的赔偿）
- 死亡赔偿金：依据受诉法院所在地上一年度城镇居民人均可支配收入或农村居民人均纯收入标准，计算二十年。对于六十岁以上者，年龄每增加一岁减少一年；七十五周岁以上者，按五年计算。
- 丧葬费：按照受诉法院所在地上一年度职工月平均工资标准，计算六个月总额。
- 被扶养人生活费：根据被扶养人丧失劳动能力程度，依据受诉法院所在地上一年度城镇居民人均消费性支出或农村居民人均年生活消费支出标准计算。被扶养人为未成年人的，计算至十八周岁；若无劳动能力又无其他生活来源，则计算二十年。同样，六十岁以上者减一年，七十五岁以上者按五年计。
- 精神损害抚慰金：根据《最高人民法院关于确定民事侵权精神损害赔偿责任若干问题的解释》，综合考虑侵权人的过错程度、侵权行为后果及受诉法院所在地的平均生活水平等因素来确定。
三、赔偿项目详解
司机对他人的赔偿项目
- 人身损害赔偿：涵盖医疗费、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费及必要的营养费等。若造成残疾，还需赔偿残疾赔偿金、残疾辅助器具费、被扶养人生活费，以及因康复护理、继续治疗实际发生的必要费用。若致人死亡，还应赔偿丧葬费、被扶养人生活费及受害人亲属办理丧葬事宜支出的交通费、住宿费和误工损失等合理费用。
- 财产损害赔偿：针对因事故导致的他人财产损失进行赔偿，如车辆维修费、物品损失等。
四、实际操作建议
- 及时报警并保留证据：事故发生后应立即报警，由交警部门出具事故责任认定书，并妥善保留相关证据材料，如医疗费用票据、财产损失清单等。
- 与保险公司沟通：及时与保险公司沟通，确保理赔流程顺畅，了解保险赔付的具体范围和限额。
- 协商或诉讼解决：双方可通过协商或调解解决赔偿问题；若无法达成一致，受害方可向法院提起诉讼，由法院依法判决。
- 咨询专业律师：鉴于赔偿问题的复杂性和专业性，建议咨询专业律师以获取准确的法律意见和帮助，确保赔偿事宜得到妥善处理，维护各方合法权益。
综上所述，交通事故中司机死亡且为主要责任方时的赔偿问题，是一个涉及法律责任、继承法及保险赔付等多方面的综合性问题。面对此类情况，应明确赔偿责任划分、详细列举赔偿项目、准确计算赔偿金额，并通过合法途径维护自身权益。