三方协议公司名称填错是否会影响毕业，这主要取决于学校及就业指导部门的具体规定以及错误被发现和纠正的时机。以下是从不同角度的详细分析：
学校及就业指导部门的规定：
- 不同学校对于三方协议的审核和管理可能存在差异。一些学校可能较为宽松，只要协议中的关键信息（如学生姓名、学号、毕业去向等）无误，且公司名称的错误不影响协议的整体效力和学生的就业权益，就可能不会对学生的毕业造成直接影响。
- 然而，也有一些学校可能较为严格，要求三方协议中的所有信息都必须准确无误。在这种情况下，如果公司名称填错，且未能在规定时间内进行更正，学校可能会因此拒绝为学生办理毕业手续或相关就业手续。
错误被发现和纠正的时机：
- 如果在提交三方协议之前或提交后不久就发现了公司名称的错误，并及时与学校和公司沟通进行了更正，那么这种错误通常不会对学生的毕业造成影响。
- 但如果错误在较长时间后才被发现，且此时已经错过了学校规定的更正期限，或者由于各种原因无法进行更正，那么学生可能会面临一定的毕业风险。
法律后果与风险防范：
- 从法律角度来看，三方协议是具有法律效力的文件。如果公司名称填错，可能会导致协议在法律上的效力受到质疑，进而影响学生的就业权益。
- 为了防范这种风险，建议学生在签订三方协议前仔细核对所有信息，确保准确无误。如果发现错误，应立即与学校和公司沟通进行更正。
- 如果已经签订了存在错误的三方协议，且无法直接更正，学生可以考虑与学校和公司协商签订补充协议或出具相关证明文件，以明确双方的权利和义务，降低法律风险。
建议与行动：
- 如果你已经发现三方协议中的公司名称填错，建议立即与学校就业指导部门和公司人力资源部门联系，说明情况并寻求更正方案。
- 在与学校和公司沟通的过程中，保持积极、诚恳的态度，提供必要的证明材料，以加快更正进程。
- 如果学校或公司提出需要签订补充协议或出具相关证明文件，务必认真对待并积极配合，以确保自己的毕业和就业权益不受影响。
如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。