被许可人在一定条件下可以提出专利侵权纠纷申请。具体来说，这取决于专利实施许可合同的类型以及合同中的具体约定。以下是对此问题的详细分析：

1. 独占实施许可合同的被许可人：

   • 在此类合同中，专利权人在约定的时间和地域范围内将专利仅许可给一个被许可人实施，且自己也不得实施。
   • 独占实施许可合同的被许可人在合同约定的范围内对专利享有排他性权利。因此，当发现专利侵权行为时，独占实施许可合同的被许可人有权单独向人民法院提起诉讼，以维护自身的合法权益。

2. 排他实施许可合同的被许可人：

   • 在此类合同中，专利权人虽将专利许可给一个被许可人实施，但自己仍有权实施。
   • 若发生专利侵权行为，且专利权人未起诉，排他实施许可合同的被许可人可以自行提起诉讼。但通常需提供专利权人不起诉的证明材料，以证明其起诉的合法性。

3. 普通实施许可合同的被许可人：

   • 在此类合同中，专利权人可许可多个被许可人实施专利，同时自己也可实施。
   • 一般情况下，普通实施许可合同的被许可人无单独起诉权。这是因为普通实施许可合同并未赋予被许可人排他性的实施权利，因此他们通常不具备直接提起诉讼的资格。
   • 但是，如果许可合同中明确约定了被许可人的起诉权，或者经专利权人书面授权，普通实施许可合同的被许可人也可以提起专利侵权诉讼。这种情况下，被许可人的起诉权是基于合同约定或专利权人的明确授权。

法律建议：

• 对于被许可人而言，在签订专利实施许可合同时，应明确约定在发生专利侵权行为时的起诉权归属问题。这有助于在后续发生纠纷时，明确各方的权利和义务，减少争议和纠纷。
• 如果被许可人发现专利侵权行为，且认为自己具备起诉权，应及时收集相关证据，并向有管辖权的人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，应充分阐述自己的诉讼请求和事实依据，以维护自身的合法权益。

可能法律后果：

• 如果被许可人未经专利权人授权或合同约定，擅自提起专利侵权诉讼，可能会面临被法院驳回起诉或承担侵权责任的法律后果。
• 如果被许可人具备起诉权但未及时行使，可能会导致专利权人的合法权益受到进一步侵害，同时也可能影响被许可人自身的商业利益。

综上所述，被许可人能否提出专利侵权纠纷申请取决于专利实施许可合同的类型以及合同中的具体约定。在签订合同时，应明确约定起诉权归属问题，并在发生纠纷时及时行使权利以维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。