结论前置：在民事诉讼中，若原告起诉的被告不适格，法院的处理方式并非直接裁定不予受理，而是会根据案件所处的具体阶段（立案阶段或审理阶段）以及被告不适格的具体情形，采取不同的处理措施。
一、立案阶段的处理
审查与告知：
- 法院在立案审查时，若发现被告主体不适格（如被告不明确、不存在或与案件无直接利害关系），通常会根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，告知原告补正被告信息或变更被告。这是因为起诉必须符合“有明确的被告”这一条件，即被告需具体、特定且与案件事实和原告的诉讼请求存在法律上的关联。
- 若原告补正后仍不能确定明确的被告，法院将裁定不予受理。这一裁定旨在确保案件符合起诉条件，避免对无关主体进行不必要的审理。
不予受理的情形：
- 根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第二百零九条，若原告提供的被告信息不足以认定明确的被告，且经法院告知补正后仍无法确定，法院将裁定不予受理。
二、审理阶段的处理
驳回起诉：
- 若案件已进入审理阶段，但法院在审理过程中发现被告不适格，且该不适格情形属于程序性问题（如被告主体错误、无诉讼行为能力等），法院将依法裁定驳回原告的起诉。这一裁定旨在纠正错误的诉讼指向，确保诉讼活动的合法性和公正性。
释明权行使与变更被告：
- 在某些情况下，如原告因法律知识欠缺而误列被告，法院可行使释明权，告知原告变更被告。若原告同意变更，则案件继续审理；若原告拒绝变更，则法院可能裁定驳回起诉。
- 法院也可依职权或依申请追加或更换当事人，以确保诉讼的顺利进行和当事人合法权益的保障。
实体判决的特殊情况：
- 在极少数情况下，若被告不适格的情形不影响案件的实体审理和判决结果（如被告虽不适格但应承担某种法律责任，如连带责任），且法院认为现有证据足以支持原告的诉讼请求，法院可在查明事实的基础上作出实体判决。但这种情况较为少见，且需严格遵循法律规定和司法解释。
三、后续救济途径
上诉：
- 原告对法院作出的驳回起诉裁定不服的，有权在裁定书送达之日起十日内向上一级人民法院提起上诉。通过上诉，原告可以寻求更高一级法院的审查和裁决，以维护自己的合法权益。
另行起诉：
- 若法院裁定驳回起诉后，原告发现新的适格被告，可依法另行提起诉讼。在另行起诉时，原告需确保新的被告符合法律规定的条件，且与案件事实和诉讼请求存在法律上的关联。
四、实际案例与法律建议
- 实际案例：假设原告因合同纠纷起诉某公司，但误将该公司的分公司列为被告。在审理过程中，法院发现分公司并非独立法人，无诉讼主体资格，因此裁定驳回原告的起诉。原告随后发现应起诉总公司，并依法另行提起了诉讼。
- 法律建议：在提起诉讼前，原告应仔细审查被告的身份和资格，确保被告符合法律规定的条件。若对被告的身份和资格存在疑问，可咨询专业律师或相关机构进行确认。在诉讼过程中，若法院发现被告不适格并告知原告变更或追加被告时，原告应积极配合并尽快完成相关手续，以确保诉讼活动的顺利进行。
总结：在民事诉讼中，若原告起诉的被告不适格，法院的处理方式并非直接裁定不予受理，而是会根据案件所处的具体阶段和被告不适格的具体情形采取不同的处理措施。原告应了解相关法律规定和司法解释，积极配合法院的工作，并在必要时寻求专业律师的帮助以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。