当案子到了检察院并作出不起诉决定时，这通常意味着刑事诉讼程序在该阶段可能告一段落，但具体处理方式和后续影响还需根据不起诉的类型及案件具体情况来详细分析。以下是对此问题的全面解答：
一、不起诉的类型及原因
检察院的不起诉决定主要分为三种：
法定不起诉：
- 当犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者存在《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条规定的情形时，如情节显著轻微、危害不大不认为是犯罪，犯罪已过追诉时效期限等，检察院应当作出不起诉决定。
- 在这种情况下，犯罪嫌疑人从法律层面上被认定不构成犯罪或不应被追究刑事责任，案件就此终结。若被不起诉人在押，应当立即释放，并解除查封、扣押、冻结的财物。若因错误羁押导致合法权益受损，还可申请国家赔偿。
酌定不起诉：
- 对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，检察院可以作出不起诉决定。
- 这是检察院基于犯罪情节、悔罪表现等多方面因素综合考量后行使的自由裁量权。被酌定不起诉的犯罪嫌疑人虽不被追究刑事责任，但仍可能面临训诫、责令具结悔过、赔礼道歉、赔偿损失等非刑事处罚措施，或由主管部门予以行政处罚或行政处分。同时，被害人或公安机关若对不起诉决定有异议，可依法进行申诉或要求复议复核。
证据不足不起诉：
- 如果检察院对于二次补充侦查的案件仍然认为证据不足，不符合起诉条件，应当作出不起诉决定。
- 这种不起诉是基于证据的客观情况作出的。但若后来发现了新的证据且符合起诉条件，检察院可以重新提起公诉。公安机关若认为不起诉决定有错误，也可要求复议复核。
二、不起诉后的特殊处理情形
附条件不起诉（主要针对未成年人）：
- 适用条件：涉嫌特定罪名、可能判处一年有期徒刑以下刑罚、符合起诉条件但有悔罪表现的未成年人。
- 考验期设置：设定六个月以上一年以下考验期，期间需遵守监督考察规定。
- 处理结果：考验通过则作出不起诉决定，违反规定或犯新罪则撤销附条件不起诉并提起公诉。
特别不起诉（如企业合规改革试点）：
- 适用对象：涉案企业通过建立合规管理体系整改有效的情况。
- 程序要求：需层报省级检察院批准，目前处于探索阶段，具体处理方式可能因地区和政策而异。
三、不起诉后的法律后果及被不起诉人的权利与义务
法律后果：
- 刑事诉讼程序结束，犯罪嫌疑人将不会面临刑事审判及刑罚。
- 但若涉及行政违法或民事纠纷，被不起诉人仍需承担相应的行政责任或民事赔偿责任。
被不起诉人的权利：
- 有权在收到不起诉决定书后，如果对不起诉决定不服，可以在规定期限内向人民检察院申诉。
被不起诉人的义务：
- 应当配合检察院的工作，接受其教育、挽救和帮扶措施，以改正行为并回归社会。
综上所述，检察院的不起诉决定并不意味着案件完全终结或犯罪嫌疑人无需承担任何责任。被不起诉人应根据具体情况面对可能的其他法律责任，并积极配合检察院的后续工作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，建议咨询专业律师或相关法律机构。