当您作为被告，面对原告提交的自作借款借条时，可以按照以下步骤来处理，以有效维护自己的合法权益：
一、积极初步应对
不逃避，正面回应：首先，不要逃避诉讼。一旦收到法院的文书，如起诉状、传票等，应在规定的时间内提交答辩状，清晰、有条理地表达自己的观点和主张。
尝试协商解决：在诉讼前或诉讼过程中，您可以主动与原告进行沟通，尝试商议一个双方都能接受的还款计划或解决方案。如果达成一致，务必签订书面协议，并保留好相关证据，以备后续查证。
二、仔细审查借条
核查借条真实性：仔细检查借条上的签名、内容字迹是否与您的一致，有无伪造、篡改的痕迹。如果您对借条的真实性有疑虑，可以及时向法院申请笔迹鉴定。
检查借条完整性：确保借条的内容完整、清晰，没有歧义。特别关注借款金额、日期、还款方式等关键信息是否明确无误。
核实款项交付情况：回忆并核实借款是否实际交付给您。对于大额借款，最好有银行转账记录等凭证来佐证借款的实际发生。
三、全面收集证据
还款证据：如果您已经部分或全部还款，务必搜集相关的还款凭证，如银行转账记录、收条等。
沟通记录：保存与原告的聊天记录、通话录音等，特别是那些涉及借款、还款内容的沟通记录，这些可能成为您抗辩的重要证据。
证人证言：如果借款或还款时有证人在场，您可以尝试获取他们的证言，以证明借款或还款的事实情况。
四、考虑抗辩事由
诉讼时效抗辩：确认借款是否已经超过了法律规定的诉讼时效。如果超过了三年诉讼时效，且在此期间原告没有向您催款，您可以提出诉讼时效抗辩。
非自愿借条抗辩：如果借条是在您受胁迫、欺诈等非自愿情况下出具的，您应收集相关证据，如报警记录、视频等，来主张借条无效。
五、依法参与庭审
遵守法庭纪律：按时参加庭审，严格遵守法庭纪律，尊重法官和对方当事人。
清晰陈述事实：在庭审过程中，清晰、准确地陈述自己的观点和理由，提供充分的证据来支持自己的主张。
有效质证：对对方提交的证据进行仔细审查，指出其在真实性、合法性、关联性方面存在的问题，削弱其证明力。
考虑调解：在庭审过程中，您可以配合法院的调解工作，根据实际情况考虑是否接受调解方案。如果调解成功，可以节省时间和精力，避免进一步的法律纠纷。
六、注意事项
增强时效意识：务必在诉讼时效内采取法律行动，避免债权因超过诉讼时效而失去法律保护。
重视证据收集：证据的充分性和有效性是胜诉的关键。因此，您应尽可能全面地收集证据，并确保证据的真实性和合法性。
合法合规维权：在维权过程中，您应严格遵守法律规定，不得采取非法手段来获取证据或干扰诉讼进程。
最后，我建议您在整个过程中咨询专业律师的意见和指导。律师可以根据您的具体情况提供更具体的法律建议，帮助您更好地维护自己的合法权益。