在面对交警查车时，如果车主选择逃跑且拒不配合调查，这是一种严重的违法行为，将会面临一系列的法律后果。以下是对此问题的详细解答：
一、法律后果分析
行政处罚：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，单纯拒绝检查或弃车逃跑，即使未造成其他严重后果，机动车驾驶人也将被处以警告或者二十元以上二百元以下的罚款。
- 若逃跑行为被认定为阻碍国家机关工作人员依法执行职务，依据《中华人民共和国治安管理处罚法》第五十条，将面临警告或者二百元以下罚款；情节严重的，还可能被处以五日以上十日以下拘留，并可并处五百元以下罚款。
刑事责任：
- 如果逃跑过程中使用了暴力或威胁方法阻碍交警依法执行职务，那么可能触犯《中华人民共和国刑法》第二百七十七条规定的妨害公务罪，将面临三年以下有期徒刑、拘役、管制或者罚金的处罚。
- 若逃跑行为导致交通事故，特别是造成人员伤亡后逃逸的，将构成交通肇事逃逸罪。根据《中华人民共和国刑法》第一百三十三条，处三年以上七年以下有期徒刑；因逃逸致人死亡的，处七年以上有期徒刑。
其他后果：
- 逃跑过程中若引发交通事故，根据事故的严重程度和责任认定，驾驶员还需承担相应的民事赔偿责任。
- 公安交管部门还有权采取诸如冻结银行账户、查封财产等强制措施，并可能扣除相应的驾驶证记分。
二、交警部门的应对措施
立即追捕与通知拦截：
- 交警在确保安全的前提下，会采取必要措施进行追捕，如动用警车追赶、通知其他路口交警设卡拦截等，以尽快截获逃跑车辆。
利用技术手段追踪：
- 交警部门会利用交通监控系统、车牌识别系统等技术手段，追踪逃跑车辆的行踪，以便及时找到并处理逃跑者。
依法严肃处理：
- 一旦将逃跑者抓获，交警会根据其具体违法行为和情节轻重，严格按照相关法律法规进行严肃处理，绝不姑息。
三、建议与指导
面对交警查车，作为车主或驾驶员，应积极配合交警的工作，出示相关证件，并如实回答交警的问题。逃避检查不仅违法，还可能引发更严重的法律后果，包括行政处罚、刑事责任以及民事赔偿责任等。因此，建议驾驶员在遇到交警查车时，保持冷静，遵守交通规则，共同维护道路交通秩序和安全。如果确实存在违法行为，应主动接受处罚并改正，而不是选择逃跑或拒不配合调查。