股东大会在符合法定条件的情况下是可以变更公司章程的。以下从多个角度为您详细分析：

一、法律依据与法定程序

根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，股东会会议若要作出修改公司章程的决议，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。这是变更公司章程的基本法律条件，也是确保决议合法性和有效性的关键。具体程序包括：

1. 草拟修改草案：由公司董事会或相关机构提出修改公司章程的草案，明确需要修改的内容。
2. 股东会表决：将修改草案提交给股东大会进行审议和表决。对于有限责任公司，须经代表三分之二以上表决权的股东通过；对于股份有限公司，则需出席股东大会的股东所持表决权的三分之二以上同意。
3. 登记与备案：根据修改内容是否涉及登记事项，需向公司登记机关办理变更登记或备案手续。

二、实际操作中的考虑因素

在实际操作中，股东大会能否成功变更公司章程，还受到多种因素的影响：

1. 股东出席情况：若部分股东选择不参加股东大会，其影响主要体现在对股东大会召开和决议通过的影响上。如果出席会议的股东所代表的表决权未达到法定要求（即三分之二以上），则无法通过修改公司章程的决议。
2. 公司章程的特殊规定：公司章程本身可能在不违反法律强制性规定的前提下，对股东会的议事方式和表决程序作出细化规定。因此，在修改公司章程时，还需确保符合公司章程的特殊规定。
3. 公司类型与特殊要求：不同类型的公司（如上市公司）在股东会的召开、决议通过等方面可能存在特殊规定。例如，上市公司需遵循更为严格的程序和信息披露要求。

三、变更公司章程的注意事项

在变更公司章程的过程中，还需特别注意以下几点：

1. 内容合法合规：修改后的公司章程内容不得违反法律、行政法规和国务院决定的规定，确保公司的运营活动在法律框架内进行。
2. 保护股东权益：在修改过程中，应充分考虑并平等对待所有股东的合法权益，避免通过修改章程来不合理地剥夺或损害任何一方的利益。特别是小股东的权益，更应得到充分的保护和尊重。
3. 遵循程序公正：所有修改步骤均需严格按照法律法规和公司章程规定的程序进行，确保修改过程的公正性和透明度。

四、举例说明

假设一个公司拥有10名股东，共持有100%的表决权。若其中3名股东选择不参加股东大会，合计持有20%的表决权。在此情况下，若其余7名参加会议的股东所持表决权达到或超过三分之二（即66.7%及以上），则股东大会可以合法通过变更公司章程的决议。反之，若出席的股东表决权不足，则无法通过修改公司章程的决议。

总结与建议：股东大会在符合法定条件的情况下是可以变更公司章程的，但关键在于实际出席的股东所代表的表决权是否满足法定要求及通过修改章程所需的表决权比例。为确保决议的有效性和合法性，建议公司在召开股东大会前做好充分准备，并严格遵循相关法律和公司章程的规定。如果您在变更公司章程过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。