结论：跨省合作未结尾款，可以通过网上申请仲裁的方式来解决，但具体能否成功受理及后续执行，还需根据合同中的仲裁条款、仲裁机构的规则以及相关法律法规来判断。
分析说明：
仲裁条款的存在：
- 首先，需要确认双方签订的合同中是否包含有效的仲裁条款。仲裁条款是双方约定将争议提交仲裁解决的书面协议，是仲裁机构受理案件的前提。
- 如果合同中有明确的仲裁条款，且该条款符合法律法规的规定（如指定了具体的仲裁机构、仲裁事项等），那么双方就有义务按照仲裁条款的约定进行仲裁。
网上申请仲裁的可行性：
- 随着互联网技术的发展，许多仲裁机构都提供了网上申请仲裁的服务。这大大方便了当事人，尤其是跨省合作的双方，可以节省时间和成本。
- 网上申请仲裁通常需要当事人按照仲裁机构的规则，在线填写仲裁申请书、提交相关证据材料等。仲裁机构在收到申请后，会进行审查，决定是否受理。
仲裁机构的受理与裁决：
- 如果仲裁机构受理了案件，会按照仲裁规则组成仲裁庭，对案件进行审理。仲裁庭会根据双方提交的证据和法律规定，作出裁决。
- 仲裁裁决具有法律效力，如果一方不履行裁决，另一方可以向法院申请强制执行。
注意事项：
- 在网上申请仲裁前，建议仔细阅读仲裁机构的规则，了解申请流程、所需材料、费用标准等。
- 确保提交的仲裁申请书和证据材料真实、完整、合法，以免影响仲裁机构的受理和裁决。
- 如果对仲裁过程或裁决结果有异议，可以在规定的时间内向仲裁机构提出异议或申请撤销裁决。
特殊场景：
- 如果合同中没有仲裁条款，或者仲裁条款无效，那么双方可能需要通过诉讼的方式来解决争议。此时，需要向有管辖权的法院提起诉讼，并按照法院的诉讼程序进行。
行动建议：
- 检查合同：首先检查合同中是否有有效的仲裁条款，以及该条款是否符合法律法规的规定。
- 了解仲裁机构规则：如果合同中有仲裁条款，且决定通过仲裁解决争议，那么需要了解所选仲裁机构的规则，包括网上申请仲裁的流程、所需材料等。
- 准备申请材料：按照仲裁机构的规则，准备仲裁申请书和相关证据材料。
- 提交申请并等待受理：在线提交仲裁申请，并等待仲裁机构的审查结果。如果受理，则按照仲裁庭的安排进行后续程序；如果不受理，则根据仲裁机构的反馈进行相应处理。
如果有任何关于跨省合作未结尾款或网上申请仲裁的具体问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。