企业纪委在企业中主要承担的是监督执纪问责的职责，其核心任务是确保企业的党风廉政建设和反腐败工作得到有效落实，维护企业的纪律和规矩。关于企业纪委是否可以制定企业制度，这个问题需要从多个角度来分析。
首先，从职责定位上看，企业纪委并不直接负责企业制度的制定。企业制度的制定通常是由企业的管理层、法务部门或专门的制度制定机构来负责的，这些部门会根据企业的实际情况、法律法规要求以及行业规范等因素，来制定和完善企业的各项规章制度。
然而，企业纪委在制度制定过程中可以发挥重要的监督和指导作用。具体来说：
监督作用：企业纪委可以监督企业制度的制定过程，确保制度的制定符合法律法规要求，不违背党的纪律和国家政策，同时防止制度制定过程中出现利益输送、权力寻租等腐败行为。
指导作用：企业纪委可以根据党风廉政建设和反腐败工作的需要，向企业制度制定部门提出建议和意见，推动将廉洁风险防控、纪律要求等内容纳入企业制度之中，从而增强制度的针对性和实效性。
参与制定特定制度：在某些特定情况下，如涉及党风廉政建设、反腐败工作等方面的专项制度，企业纪委可能会直接参与制定过程，以确保这些制度能够切实发挥作用，有效防范廉洁风险。
以您提供的参考信息为例，特区建工集团和四川发展（控股）有限责任公司的纪委在推动企业制度建设方面就发挥了积极作用。他们通过印发相关实施方案、工作实施细则等文件，积极推进内部控制体系建设，建立健全监督体系，并将廉洁风险防控嵌入各个管理层级和业务流程。这些举措不仅有助于提升企业的治理效能，也为企业纪委更好地履行监督执纪问责职责提供了有力支撑。
综上所述，企业纪委本身并不直接制定企业制度，但可以在制度制定过程中发挥监督和指导作用，并在特定情况下参与制定涉及党风廉政建设、反腐败工作等方面的专项制度。这样的安排既符合企业纪委的职责定位，也有助于提升企业制度的质量和实效性。