结论前置：公司办公设备被邻居公司占用，这一行为是否违法需视具体情况而定，但通常情况下，未经允许占用他人财物可能构成侵权或违法。
详细分析：
从物权法角度分析：
- 根据《中华人民共和国民法典》中关于物权的规定，公司对其办公设备享有所有权，即公司有权占有、使用、收益和处分其办公设备。
- 邻居公司未经允许占用公司办公设备，侵犯了公司的物权，具体表现为对物的占有权和使用权的侵犯。
- 公司有权要求邻居公司返还办公设备，并可以要求赔偿因占用而造成的损失。
从侵权责任法角度分析：
- 邻居公司的占用行为，如果造成了公司办公设备的损坏或无法正常使用，还可能构成侵权责任。
- 根据侵权责任法的相关规定，侵权人应当承担停止侵害、恢复原状、赔偿损失等民事责任。
- 公司可以要求邻居公司停止占用，恢复办公设备的原状，并赔偿因占用和损坏而造成的损失。
从实际占有与使用情况分析：
- 如果邻居公司只是短暂、临时地使用了公司的办公设备，且未造成任何损坏或影响公司的正常使用，这种情况可能不构成严重的违法或侵权。
- 但即便如此，邻居公司的行为仍然未经公司允许，公司有权要求邻居公司停止使用并返还设备。
- 如果邻居公司长期、持续地占用公司办公设备，且拒绝返还或赔偿，那么这种行为就明显构成了违法和侵权。
法律建议：
- 与邻居公司协商：首先，建议公司尝试与邻居公司进行友好协商，明确表达对其占用办公设备的不满和要求返还的意愿。
- 发送律师函：如果协商无果，公司可以委托律师向邻居公司发送律师函，正式要求其返还办公设备并赔偿损失。
- 提起诉讼：如果邻居公司仍然拒绝履行义务，公司可以向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
可能法律后果：
- 如果邻居公司被认定构成侵权或违法，可能需要承担返还设备、赔偿损失等民事责任。
- 在极端情况下，如果邻居公司的行为构成犯罪（如盗窃罪），还可能面临刑事责任的追究。
总结与提醒：
公司办公设备被邻居公司占用是一个涉及物权法和侵权责任法的问题。公司有权要求邻居公司返还设备并赔偿损失。在处理此类问题时，建议公司先尝试与邻居公司协商解决，如果协商无果再考虑采取法律手段。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。