结论：在工商部门以涉嫌卖假药为由搜查手机，但最终发现并非假药的情况下，你可以通过核实并质疑调查结果、保留并补充证据、申诉与举报以及寻求法律帮助等途径来维护自身权益。

1. 核实并质疑调查结果

• 详细了解调查报告：首先，你有权向工商部门申请查看详细的调查报告，包括他们判断药品为真的依据、相关的检测报告或证据材料。这是了解整个调查过程和结果的基础。
• 审查检验报告的合规性：仔细审查检验报告的全面性、检验方法的合规性，以及是否有厂家证明和进货渠道合法性证明等文件。如果发现检验报告存在瑕疵或不合规之处，你可以提出质疑。
• 申请复核或重新鉴定：若对提供的证据存疑，你可以申请由工商部门或药品监督管理部门指定的其他权威检验机构进行复核或重新鉴定。确保新的鉴定机构与初检机构无利害关系，以保证结果的公正性和准确性。

2. 保留并补充证据

• 保留关键证据：妥善保管购药凭据，如发票、收据、药品包装、说明书等。这些证据是后续申诉、举报或法律诉讼的关键支持。
• 提供新线索和证据：仔细回顾购买和使用药品的过程，寻找可能遗漏的线索或证据。例如，如果发现药品包装上的防伪标识异常，应及时拍照并提供给相关部门。

3. 申诉与举报

• 向上级部门反映：如果认为工商部门的调查过程存在程序问题或不公正情况，你可以向上级工商行政管理部门进行申诉。提供详细的申诉材料和证据，说明你认为存在的问题。
• 向监察机关投诉：如怀疑工商调查人员存在违法违纪行为，你可以向监察机关投诉，要求其进行调查和处理。
• 向药品监管部门投诉：药品的真伪认定主要由药品监督管理部门负责。你可以向当地药品监管部门提交投诉材料，详细说明质疑点。药品监管部门将依据其专业能力和手段进行调查核实。

4. 寻求法律帮助

• 了解法律途径：如果申诉或举报无果，你可以向我咨询，了解你的权益和可能的法律途径。我会根据你的具体情况提供合适的法律建议，帮助你制定维权策略。
• 通过司法途径解决：若必要，你可以向人民法院提起民事诉讼，申请法院委托专业的药品鉴定机构进行鉴定。根据鉴定结果，你可以要求销售方承担相应的法律责任，如赔偿损失等。

额外建议：

• 在整个过程中，务必保持冷静和理性，避免采取过激行为或发表不当言论。
• 确保所有提供的证据都是真实、合法且有效的，避免提供虚假证据或伪造证据。
• 如果卖假药的行为确实存在但未被工商部门发现，且该行为涉嫌犯罪（如销售金额巨大或对人体健康造成严重危害），你也可以直接向公安机关报案。

总结：面对工商部门以涉嫌卖假药为由搜查手机但最终发现并非假药的情况，你应通过核实并质疑调查结果、保留并补充证据、申诉与举报以及寻求法律帮助等途径来维护自身权益。在整个过程中，务必保持证据的完整性和真实性，以确保你的权益得到有效保护。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。