结论前置：针对您“工商未占股权但是有投资怎么签协议”的问题，核心在于通过签订一份详尽且合法的投资协议来明确双方的权利与义务，即便在工商登记中未体现股权，您的投资权益也能得到法律保障。以下是从不同角度给出的具体分析和建议：
一、协议的核心要素
明确投资性质与金额：
- 协议中应清晰界定您的投资是股权投资、债权投资还是其他形式的投资。
- 明确投资金额、支付方式及支付时间，确保双方对投资规模有共同的理解。
约定权益与回报：
- 即便工商未登记股权，协议中也应详细规定您作为投资者的权益，如分红权、决策参与权（如通过股东会或董事会决议）、知情权等。
- 约定投资回报的方式和条件，如固定回报、按比例分红或股权回购等。
风险分担与违约责任：
- 明确投资过程中可能遇到的风险及双方如何分担这些风险。
- 设定违约责任条款，包括违约金的数额或计算方式，以及违约方需承担的其他法律责任。
退出机制：
- 约定在特定情况下（如公司上市、被收购或经营不善等）您如何退出投资，包括退出方式、退出价格及时间等。
二、协议的法律形式与效力
书面协议：
- 投资协议应以书面形式签订，确保双方的权利与义务有明确的文字记录。
- 书面协议具有更强的法律效力，便于在发生纠纷时作为证据使用。
合法性与合规性：
- 协议内容应符合相关法律法规的规定，不得违反法律、行政法规的强制性规定。
- 确保协议签订过程合法合规，如双方具有完全民事行为能力、协议内容真实自愿等。
三、实际操作建议
寻求专业法律帮助：
- 在签订投资协议前，建议咨询专业律师，确保协议内容合法合规且充分保护您的权益。
- 律师可以协助您审查协议条款，提出修改建议，并解释相关法律后果。
工商备案与公示（虽非直接股权登记，但可增强透明度）：
- 尽管工商未登记股权，但您可以考虑将投资协议或相关权益证明在公司内部进行备案或公示，以增强透明度并减少潜在纠纷。
- 这并非法律要求，但有助于维护公司内部的和谐与稳定。
保留相关证据：
- 保存好投资协议、支付凭证、公司财务报表等相关证据，以备不时之需。
- 这些证据在发生纠纷时将起到至关重要的作用。
四、示例条款（仅供参考）
以下是一个简化的投资协议示例条款，供您参考：
“投资条款：
- 甲方（投资者）向乙方（公司）投资人民币XX万元，占乙方总投资的XX%。
- 甲方享有按投资比例分红的权利，分红时间为每年XX月XX日。
- 乙方应定期向甲方提供财务报表，确保甲方对乙方的经营状况有充分了解。
- 如乙方发生重大经营变化（如上市、被收购等），甲方有权按约定条件退出投资。
- 双方应严格遵守本协议条款，如一方违约，应向守约方支付违约金人民币XX万元。”
最后，签订投资协议是一个复杂且重要的过程，涉及多方面的法律知识和实践经验。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详尽且专业的法律建议。