农村自建祠堂是否合法，主要取决于是否符合相关法律法规、土地用途规定、建设规划以及是否办理了相关审批手续。以下是对此问题的详细分析：
一、合法建设祠堂的情况
符合规划要求：
- 建设祠堂需经过相关部门的审批，并获得建设工程规划许可证等必要证件。祠堂的建设地点应与村庄的总体规划和土地利用规划相一致，满足建筑密度、高度、间距等规划指标。
- 例如，若祠堂建设选址在规划中的公共建设区域内，且符合所有规划要求，则具备合法建设的基础条件。
获得必要审批：
- 用地审批：应取得合法的土地使用手续。对于集体建设用地，需经本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员或代表同意，并报乡（镇）人民政府审核，最终由县级人民政府批准。
- 建设工程规划许可：需向城乡规划主管部门或相关建设管理部门申请建设工程规划许可证，提交建筑设计方案、用地证明等材料，经审核符合规划要求后方可建设。
不超出宅基地或建设用地范围：
- 如果祠堂是建在宅基地上，建设活动应严格在宅基地规定的面积和边界内进行，不得侵占公共道路、公共绿地或他人宅基地。
- 如果祠堂是建在集体建设用地上，同样需要确保不超出批准的建设用地范围。
遵守其他相关规定：
- 在建设过程中，必须严格遵守国家和地方关于建筑质量、安全、环保等方面的法律法规和标准规范，确保建筑材料质量合格，施工安全措施到位，避免对周边环境造成污染。
二、违法建设祠堂的情况
未经审批擅自建设：
- 未向相关部门提出申请并获得批准就自行建造祠堂，违反了《中华人民共和国城乡规划法》等相关法律法规。
不符合规划要求：
- 即使获得了审批，但建设的祠堂不符合当地规划要求，如在禁止建设大型建筑的区域内建设规模过大的祠堂，或建筑高度超过限制等。
超出宅基地或建设用地范围：
- 建设过程中超出了宅基地或建设用地的法定使用面积和边界，侵占了公共空间或他人的合法权益，侵犯了物权或公共利益。
违反土地用途规定：
- 未经批准擅自改变土地用途，如将原本用于农业或其他用途的土地擅自改为建设祠堂用地。
破坏环境和资源：
- 建设过程中若造成生态环境破坏、水土流失等问题，或违反文物保护等相关规定，如破坏具有历史文化价值的古建筑、古遗址等。
三、法律后果
若在建设祠堂的过程中存在违法行为，相关部门可能会责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可能会面临拆除等行政处罚。此外，还可能因侵犯他人权益而承担民事责任，如赔偿损失等。
四、建议
为避免不必要的法律纠纷和处罚，村民在决定建设祠堂前，应充分了解并遵守当地的相关法律法规和规划要求。具体建议如下：
- 事先咨询与审批：在建设祠堂前，务必咨询当地自然资源、城乡规划、建设等相关部门，了解具体的申报和审批流程，并严格按照要求办理相关手续。
- 土地合规使用：确保所选土地符合土地利用规划，不占用永久基本农田，避免土地违法风险。
- 公开透明集资：如果祠堂建设涉及集资，应保持公开透明，明确资金用途，接受村民监督，确保资金管理的合法性和规范性。
- 遵守建筑法规：按照建筑法规进行设计和施工，确保祠堂建筑的安全性和合规性。
综上所述，农村自建祠堂的合法性是一个综合考量的问题，需要严格遵守相关法律法规和办理完整的报建手续。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。