非法经营罪的罚金是否能低于违法所得的一倍，这个问题涉及到对相关法律规定的理解和适用。以下是对此问题的详细解答：

首先，我们需要明确《中华人民共和国刑法》第二百二十五条关于非法经营罪的基本规定。该条规定，对于扰乱市场秩序，情节严重的非法经营行为，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金。同时，对于情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。

接下来，我们分析“并处或单处罚金”的含义。在基本量刑档次中，法院可以选择并处罚金，即同时判处主刑和附加刑（罚金），也可以单独判处罚金，不判处主刑。这里需要注意的是，若单独判处罚金，则并不受“最低判处一倍以上”的限制，因为此时没有主刑作为参照。

再来看“一倍以上五倍以下”的适用范围。这个范围仅适用于需要并处罚金的情形，且具体倍数由法院根据犯罪情节决定。如果法院选择单独判处罚金，那么就不受此比例的限制，罚金数额可能会低于违法所得的一倍，甚至可能只是象征性的处罚。

此外，我们还需要考虑到实际案例中的灵活性。在司法实践中，如果非法经营的违法所得数额较小，或者存在其他从轻情节，法院可能会通过单独判处罚金来实现更轻的刑罚效果。例如，在某非法经营案件中，如果违法所得为5万元，法院可能会单独判处2万元罚金，这明显低于违法所得的一倍。

综上所述，非法经营罪的罚金并不一定要高于或等于违法所得的一倍。法院在判决时会根据具体的犯罪情节、违法所得数额以及被告人的实际情况等因素来综合考虑，并据此决定罚金的数额。因此，在实际案例中，罚金低于违法所得一倍的情况是有可能发生的。