工程半路停工时，预付款的计算与处理需根据合同约定、停工原因及法律规定综合判断，具体分以下几种情况处理：

1. 合同有明确约定时，按合同条款执行

• 若合同中约定了“停工时预付款的退还规则”（如按已完成工程量比例退还、扣除违约金后退还等），则双方应优先按合同执行。
• 示例：合同约定“若因发包方原因停工，预付款按已完成工程量的80%退还；若因承包方原因停工，预付款不予退还”，则需按此比例结算。

2. 合同无约定或约定不明时，按实际损失协商或诉讼解决

• 发包方原因停工（如未按时支付工程款、未提供施工条件等）：
  • 承包方有权要求发包方继续履行合同或赔偿损失，预付款通常需退还（可能扣除已使用部分或违约金）。
  • 法律依据：根据《民法典》第577条，违约方需承担继续履行、赔偿损失等责任。
• 承包方原因停工（如施工能力不足、擅自停工等）：
  • 发包方有权要求承包方返还预付款，并可能要求赔偿停工损失（如工期延误罚款、另行委托施工的差价等）。
  • 法律依据：根据《民法典》第563条，一方根本违约时，对方可解除合同并要求赔偿。
• 不可抗力或双方无过错停工（如自然灾害、政策调整等）：
  • 预付款通常按公平原则处理，可能按已完成工程量比例退还，或双方协商分担损失。
  • 法律依据：根据《民法典》第180条，不可抗力导致合同无法履行的，部分或全部免除责任。

3. 关键操作建议

• 固定证据：停工后，双方应立即书面确认停工原因、已完工程量、预付款使用情况等，避免后续争议。
• 协商优先：通过补充协议明确预付款退还方式，减少诉讼成本。
• 诉讼/仲裁：若协商不成，可依据合同约定向法院起诉或申请仲裁，主张预付款返还及损失赔偿。

总结：预付款的处理需结合合同条款、停工原因及实际损失综合判断。建议双方先协商，若无法达成一致，可通过法律途径解决。如有具体合同条款或停工细节，可进一步向我咨询，我会结合实际情况为您详细分析。