取保候审保证金在不起诉后未退还，属于违法行为，可依法主张退还并追究相关责任。具体分析如下：

1. 法律依据与程序要求
   根据《刑事诉讼法》第73条及《公安机关办理刑事案件程序规定》第97条，取保候审保证金应在解除取保候审时立即退还。若案件作出不起诉决定（包括法定不起诉、酌定不起诉或存疑不起诉），公安机关应在收到不起诉决定书后3日内退还保证金。若未退还，可能涉及程序违法。

2. 未退还的常见原因及应对措施

   • 程序延误：公安机关可能因内部流程（如文书传递、审批滞后）未及时退还。
     应对：向作出不起诉决定的检察院申请出具《退还保证金通知书》，或直接向公安机关提交书面退还申请，要求限期处理。
     
   • 存在未结事项：如被取保候审人违反取保候审规定（如未按时报到、干扰证人），公安机关可能暂扣保证金。
     应对：要求公安机关出具书面说明，核实是否存在违规行为。若不存在，可申请行政复议或提起行政诉讼；若存在，需根据规定接受处罚后申请退还。
     
   • 系统或财务问题：部分地区因财政系统升级或账户管理问题导致退还延迟。
     应对：联系公安机关财务部门或上级督察部门，要求出具书面退款计划并跟进执行。

3. 救济途径

   • 行政申诉：向公安机关的法制部门或督察部门提交书面申诉，要求限期退还并赔偿利息损失。
     
   • 检察监督：向作出不起诉决定的检察院申请立案监督，由检察院督促公安机关履行退还义务。
     
   • 行政诉讼：若公安机关无正当理由拒不退还，可向法院提起行政诉讼，要求确认其行政行为违法并强制退还。
     
   • 国家赔偿：若因公安机关违法扣押导致财产损失，可依据《国家赔偿法》申请赔偿（需证明违法行为与损失的因果关系）。

4. 实务建议

   • 保留证据：保存取保候审决定书、保证金缴纳凭证、不起诉决定书等文件，作为维权依据。
     
   • 书面催告：通过EMS向公安机关寄送《退还保证金催告函》，明确要求限期退还并保留寄送凭证。
     
   • 联合申诉：若涉及多人保证金未退还，可联合其他当事人共同申诉，增强维权力度。
     

提示：若公安机关仍拒不退还，建议委托律师介入，通过法律程序强制执行。实践中，此类案件通过律师发函或提起诉讼后，退还效率通常显著提高。