结论：不可以直接注销车辆，但可以通过法律途径要求返还车辆或解决纠纷。

1. 车辆注销的法定条件
   根据《机动车登记规定》（公安部令第164号），车辆注销需满足法定情形，如报废、灭失、因质量问题退车等。单纯因他人占有车辆（如男友扣车）不属于法定注销理由，车管所不会受理此类注销申请。若擅自提供虚假材料注销，可能涉嫌违法。

2. 你的权利与解决路径

   • 物权保护：车辆登记在你名下，你作为所有权人可依据《民法典》第235条要求男友返还车辆。若对方拒不返还，可向法院起诉主张“返还原物请求权”，并可申请财产保全防止车辆被转移。
     
   • 报警处理：若男友非法扣车（如通过威胁、抢夺等方式取得车辆），可能涉嫌《治安管理处罚法》第26条的“寻衅滋事”或《刑法》第245条的“非法侵入住宅”（若扣车与住宅相关），可报警要求追究行政或刑事责任。
     
   • 分手纠纷处理：若扣车与感情纠纷相关（如借款、赠与争议），需先明确车辆权属。若车辆确属你个人财产，男友无权扣留；若存在共同出资或赠与约定，需通过协商或诉讼分割财产。

3. 操作建议

   • 收集证据：保留车辆登记证、购车发票、行驶证等证明权属的文件；记录男友扣车的时间、地点、方式（如聊天记录、录音、证人证言）。
     
   • 发送律师函：委托律师向男友发送正式函件，要求限期返还车辆，否则将采取法律行动。
     
   • 起诉流程：向法院提交起诉状、证据材料，申请立案。法院受理后可安排调解或开庭审理，判决生效后可申请强制执行（如查封、扣押车辆）。

提示：若车辆被男友使用期间发生违章或事故，你作为车主可能需承担连带责任。建议尽快通过法律途径解决，避免风险扩大。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。