关于“公司先垫付然后客户贴现”是否违法的问题，需要分情况讨论，具体如下：

1. 若该行为涉及虚构交易或资金空转：

   • 法律定性：此类行为可能构成虚开增值税专用发票、骗取贷款或金融票证等违法犯罪行为。例如，若公司与客户串通，通过虚构交易合同、资金流水等方式，使银行误以为存在真实交易背景而发放贷款或贴现资金，该行为可能触犯《刑法》第一百七十五条之一（骗取贷款、票据承兑、金融票证罪）或第二百零五条（虚开增值税专用发票罪）。
   • 法律后果：若构成犯罪，公司及相关责任人可能面临有期徒刑、罚金等刑事处罚；若未达到刑事立案标准，也可能因违反《票据法》《贷款通则》等规定，被行政机关处以罚款、没收违法所得等行政处罚。

2. 若该行为属于真实交易背景下的资金垫付与贴现：

   • 法律定性：需进一步审查交易真实性、资金用途及贴现流程是否合规。例如，若公司为客户垫付货款，客户随后以真实交易产生的票据向银行申请贴现，且资金用于偿还公司垫付款，该行为本身不直接违法。
   • 潜在风险：
     • 票据合规性：若票据存在伪造、变造或背书不连续等问题，可能影响贴现效力，甚至导致银行追索权行使。
     • 资金用途限制：若贴现资金未按约定用途使用（如流入股市、房地产等限制性领域），可能违反银行监管规定，导致银行提前收回资金或追究违约责任。
     • 税务风险：若垫付资金未通过正规财务流程处理，可能引发税务机关对交易真实性的质疑，进而面临补税、罚款等税务风险。

3. 若该行为涉及非法金融活动：

   • 法律定性：若公司未经金融监管部门批准，擅自从事票据贴现业务（如向不特定对象提供贴现服务并收取费用），可能构成非法经营罪（《刑法》第二百二十五条）。
   • 法律后果：若构成犯罪，公司及相关责任人可能面临有期徒刑、罚金等刑事处罚；即使未达到刑事立案标准，也可能因违反《非法金融机构和非法金融业务活动取缔办法》等规定，被行政机关取缔并处以罚款。

法律建议：

• 审查交易真实性：确保垫付与贴现行为基于真实交易背景，避免虚构合同、资金流水等操作。
• 合规操作票据：确保票据真实、合法、有效，背书连续，并严格按照银行要求提供贴现所需材料。
• 明确资金用途：在贴现合同中明确约定资金用途，并确保资金实际用于约定目的，避免违规使用。
• 避免非法经营：若公司拟从事票据贴现业务，应依法取得金融监管部门批准，并遵守相关监管规定。

若您对具体操作流程或合规要求存在疑问，可直接向我咨询，我将结合您的实际情况提供详细解答。