结论：公司开给自然人的发票若涉及医院相关内容，是否合法需分情况讨论，关键在于发票内容是否与实际交易相符且符合税法规定。

1. 发票内容与实际交易一致时合法
   若自然人因个人原因（如购买医疗设备、药品或服务）与公司发生真实交易，公司按实际交易内容开具发票（如“医疗服务费”“药品销售”等），且自然人将发票用于合法用途（如个人报销、税务抵扣等），则该行为合法。例如：自然人因自费医疗向医疗器械公司购买设备，公司开具对应发票，符合税法要求。

2. 虚构交易或虚开发票时违法
   若公司与自然人无实际交易，仅以“医院”为名虚开发票（如虚构医疗服务、药品销售等），或发票内容与实际交易不符（如实际购买的是办公用品，但发票开为“医疗服务费”），则属于虚开发票行为。根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十二条，虚开发票（包括为他人、为自己、让他人为自己或介绍他人虚开）可能面临罚款（最高50万元）、没收违法所得，情节严重者可能构成刑事犯罪（《刑法》第二百零五条）。

3. 特殊场景需注意合规性

   • 自然人代开发票：若自然人通过税务机关代开发票给公司（如提供劳务），需确保代开内容与实际业务一致，且自然人已依法纳税。
     
   • 医院直接开票：若交易主体是医院（如自然人向医院支付医疗费），应由医院直接开具发票，公司无权代开。若公司冒用医院名义开票，属于伪造发票行为，违法性更严重。

建议：

• 公司应严格审核交易真实性，避免虚开发票；
  
• 自然人接收发票时需核对内容与实际交易是否一致；
  
• 若涉及医疗费用报销，建议优先通过医院正规渠道获取发票。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的合规问题。