结论：公务员的配偶在农村拥有房屋和土地，在符合现行法律法规规定的情况下是合法的。以下从不同角度展开分析：

1. 关于农村房屋的合法性
   根据《民法典》及相关土地管理法规，农村房屋的合法性主要取决于宅基地使用权是否依法取得。若房屋建造在配偶通过合法程序（如继承、婚前取得、与本村集体经济组织成员共同申请等）获得的宅基地上，且符合当地规划要求，则房屋所有权合法有效。
   关键点：

   • 若配偶是农村集体经济组织成员（如户籍在农村），可依法申请宅基地建房；
     
   • 若配偶非农村户籍，但通过继承房屋取得宅基地使用权（“地随房走”原则），房屋合法性受保护，但不得翻建或扩建；
     
   • 若房屋涉及违法占地、未批先建等情形，则可能被认定为违建。

2. 关于农村土地的合法性
   农村土地包括承包地和集体建设用地等，其合法性需分情况讨论：

   • 承包地：若配偶通过家庭承包方式取得土地承包经营权（如婚前已取得或婚后与本村集体成员共同承包），且未违反《农村土地承包法》中关于“承包方需为本集体经济组织成员”的规定，则合法有效；
     
   • 集体建设用地：若土地用于非农业建设（如开办企业），需依法办理农用地转用审批手续，否则可能涉嫌违法用地；
     
   • 土地流转：若配偶通过转包、出租等方式流转土地，需符合“不得改变土地农业用途”等法定条件，否则流转合同可能无效。

3. 公务员身份的特殊性
   公务员需遵守《公务员法》及《中国共产党纪律处分条例》中关于“廉洁自律”的规定，但现行法律未禁止公务员配偶合法拥有农村房产或土地。
   需注意的风险：

   • 若房屋或土地来源涉及贪污、受贿、利益输送等违法行为（如利用职务便利违规批地），则可能牵连公务员本人承担纪律或法律责任；
     
   • 若配偶通过虚假手段（如伪造集体成员身份）取得土地权益，可能面临行政处罚或刑事责任。

建议：

1. 核实房屋和土地的权属来源文件（如宅基地证、承包合同、审批手续等），确保程序合法；
   
2. 若涉及土地流转或非农业建设，提前咨询当地自然资源部门，确认是否符合规划要求；
   
3. 避免利用公务员职务影响为配偶谋取不正当土地权益，以防违反廉洁纪律。
   

如有具体案例或权属文件需进一步分析，可直接向我提供细节，我会结合法律条文为您详细解答。