结论前置：合作建房中一方未经其他合作方同意变卖房产或改变用途是否违法及如何处理，需分情况讨论，具体如下：
1. 若合作协议明确约定用途及处分权，一方擅自变卖或改变用途属于违约，可能违法
- 法律依据：根据《民法典》第301条，处分共有的不动产应当经全体共同共有人或占份额三分之二以上的按份共有人同意（合作建房通常视为共有关系）。若合作协议明确约定“未经全体同意不得处分或改变用途”，一方擅自行为构成违约，其他方可主张：
- 要求继续履行协议（如恢复原用途）；
- 要求赔偿损失（如因变卖导致的预期收益损失）；
- 申请法院撤销变卖行为（若变卖行为损害其他方利益且符合《民法典》第154条恶意串通情形）。
- 实务建议：立即收集合作协议、变卖证据（如合同、转账记录）、沟通记录等，向违约方发函要求停止行为并协商解决；若协商无果，可向法院起诉主张违约责任或申请行为保全。
2. 若合作协议未明确约定用途或处分权，需结合共有性质判断
- 按份共有：若合作方按出资比例享有份额，一方处分其份额无需其他方同意，但改变整体用途需经占份额三分之二以上同意（《民法典》第301条）。若擅自改变用途，其他方可主张：
- 分割共有物（如要求分割房产或折价补偿）；
- 要求停止侵害（如恢复原状）。
- 共同共有：若合作方未约定份额（如家庭合作建房），处分或改变用途需全体同意。擅自行为无效，其他方可主张：
- 确认变卖合同无效（若涉及第三方，需证明第三方非善意取得）；
- 要求返还房产或赔偿损失。
- 实务建议：先通过协商明确共有性质及各方权利；若无法协商，可申请法院确认共有性质（如通过共有物分割之诉），再根据结果主张权利。
3. 若变卖行为涉及行政违法或刑事犯罪，需同步追究行政或刑事责任
- 行政违法：如变卖行为未取得规划许可、施工许可等，可能违反《城乡规划法》《建筑法》，相关部门可处罚款、责令改正等。
- 刑事犯罪：若变卖行为涉嫌诈骗（如虚构合作事实骗取资金）、职务侵占（如利用职务便利侵占合作财产）等，可向公安机关报案追究刑事责任。
- 实务建议：收集行政违法证据（如无证施工照片、政府处罚决定）或刑事犯罪证据（如虚假合同、资金流向），向相关部门举报或报案。
综合处理建议
- 优先协商：明确各方诉求，尝试通过补充协议规范后续行为；
- 固定证据：保存合作协议、变卖记录、沟通记录等，避免证据灭失；
- 法律行动：根据具体情况选择起诉违约、确认合同无效、申请行为保全或报案；
- 风险防范：未来合作中建议明确约定用途、处分权、违约责任等条款，并办理共有权登记或公证。
提示：合作建房法律关系复杂，具体处理需结合协议内容、共有性质、行为后果等综合判断。如有进一步疑问或需协助处理，可直接向我咨询。