跨省涉企案件是可以立案的，但具体立案情况需结合案件性质、管辖法院及法律规定综合判断。以下从不同角度展开说明：

1. 民事案件
   根据《民事诉讼法》第22条，对法人或其他组织提起的民事诉讼，由被告住所地（即企业主要办事机构所在地）法院管辖。若合同中约定了管辖法院（如合同签订地、履行地等），且该约定不违反级别管辖和专属管辖规定，则可向约定法院立案。例如，跨省买卖合同纠纷中，若合同明确约定由买方所在地法院管辖，即使卖方在另一省，买方也可向其所在地法院起诉。

2. 刑事案件
   刑事案件由犯罪地（包括犯罪行为发生地和结果发生地）法院管辖。若企业涉及跨省犯罪（如诈骗、污染环境等），犯罪地法院均有管辖权。例如，企业总部在A省，但犯罪行为发生在B省，B省法院可立案侦查。此外，根据《刑事诉讼法》第25条，必要时可由上级法院指定管辖，解决跨省管辖争议。

3. 行政案件
   根据《行政诉讼法》第18条，行政案件由最初作出行政行为的行政机关所在地法院管辖。若企业对跨省行政机关的处罚决定不服（如环保局跨省处罚），需向该行政机关所在地法院起诉。但若经复议的案件，复议机关改变原行政行为的，也可向复议机关所在地法院起诉。

实务建议：

• 立案前需确认管辖法院，可通过企业工商登记信息、合同约定条款或行政机关所在地等线索确定；
  
• 若涉及多个法院管辖，可优先选择对企业便利的法院（如合同约定地），但需确保约定合法有效；
  
• 跨省立案可能涉及证据调取、送达等程序问题，建议提前准备完整材料（如营业执照、合同、行政处罚决定书等）以提高效率。
  

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