结论：在总公司欠款的情况下，可以同时起诉当地分公司和总公司，但需根据具体情况判断分公司是否需承担实际责任。以下从法律原理、实务操作及风险提示三个角度展开分析：

一、法律原理：分公司与总公司的责任承担规则

1. 分公司的法律地位
   根据《公司法》第14条及《民法典》第74条，分公司是总公司的分支机构，不具有独立法人资格，其民事责任最终由总公司承担。但若分公司以自己名义从事民事活动，且拥有独立管理的财产，可先以该财产承担责任，不足部分由总公司补足。

2. 共同诉讼的法律依据
   《民事诉讼法》第52条规定，当事人一方或双方为两人以上，诉讼标的是共同的或同一种类的，法院可合并审理。在总公司欠款案件中，若分公司实际参与交易（如签订合同、接收货物等），债权人可主张分公司与总公司为共同被告，要求其承担连带责任或补充责任。

二、实务操作：如何同时起诉分公司与总公司

1. 起诉条件

   • 分公司参与交易：需提供证据证明分公司直接参与债务形成（如合同签字、对账单确认等）。
     
   • 分公司有财产：若分公司拥有独立财产（如银行账户、设备等），执行阶段可优先查封其财产，提高回款效率。
     
   • 总公司偿付能力不足：若总公司资产有限，将分公司列为共同被告可扩大责任财产范围。

2. 诉讼策略建议

   • 主张连带责任：若分公司与总公司共同实施侵权或违约行为（如分公司收款后未转交总公司），可要求二者承担连带清偿责任。
     
   • 主张补充责任：若分公司仅作为总公司代理人参与交易，可要求总公司先承担责任，分公司以自有财产补充清偿。
     
   • 申请财产保全：起诉时同步申请冻结分公司银行账户或查封财产，防止资产转移。

三、风险提示：分公司可能免责的情形

1. 分公司未参与交易
   若债务完全由总公司独立形成（如总公司直接签订合同、收款），分公司未参与任何环节，法院可能驳回对分公司的起诉。

2. 分公司无独立财产
   若分公司财产与总公司混同（如资金统一调配、账目不分），法院可能认定分公司无独立偿付能力，仅判决总公司承担责任。

3. 内部授权限制
   若总公司明确限制分公司对外签约权限（如公司章程规定分公司需总公司书面授权），且债权人明知该限制，分公司可能免责。

四、操作步骤示例

假设A总公司欠B公司货款100万元，C分公司实际接收货物并签署对账单：

1. 准备证据：合同（显示A公司为买方）、送货单（显示C分公司签收）、对账单（C分公司盖章确认）。
   
2. 起草诉状：将A总公司与C分公司列为共同被告，主张二者承担连带清偿责任。
   
3. 申请保全：向法院申请冻结C分公司银行账户（如账户内有资金）或查封其设备。
   
4. 参与庭审：强调C分公司实际参与交易且拥有独立财产，要求法院判决二者共同还款。

总结：同时起诉分公司与总公司是合法且可行的策略，但需结合分公司参与程度、财产独立性等具体证据设计诉讼方案。建议委托律师协助调查分公司财产状况、梳理交易流程，以制定最优维权路径。如有进一步疑问，可直接向我咨询。