再审程序中一般不允许提起反诉，但存在特定例外情形。以下从法律规定、理论依据及实践操作三个层面进行详细分析：

一、法律规定层面

根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第二百五十二条，再审裁定撤销原判决、裁定发回重审的案件，当事人申请变更、增加诉讼请求或者提出反诉，需符合下列情形之一，人民法院才应当准许：

1. 原审未合法传唤缺席判决，影响当事人行使诉讼权利的：若原审法院未依法传唤当事人，导致其未能参与诉讼并行使相关权利，再审发回重审时，当事人可提出反诉。
2. 追加新的诉讼当事人的：在再审过程中，若需追加新的诉讼当事人，且该追加与反诉的提出具有直接关联，法院可准许反诉。
3. 诉讼标的物灭失或者发生变化致使原诉讼请求无法实现的：若诉讼标的物在原审后发生灭失或变化，导致原诉讼请求无法实现，当事人可在再审发回重审时提出反诉。
4. 当事人申请变更、增加的诉讼请求或者提出的反诉，无法通过另诉解决的：若当事人提出的反诉与原审案件具有紧密关联，且无法通过另行起诉的方式解决，法院可准许反诉。

除上述特定情形外，再审程序一般不允许提出反诉。

二、理论依据层面

1. 维护生效裁判的稳定性：生效裁判具有既判力，即法院作出的终局判决一旦生效，当事人和法院都应当受该判决的拘束。若允许在再审程序中随意提出反诉，将破坏生效裁判的稳定性，导致法律关系长期处于不确定状态。
2. 保障诉讼效率：再审程序的启动通常意味着原案件的审理已经经过了较长时间，且可能已经经历了多轮诉讼程序。若再审中允许提出反诉，将导致诉讼程序的进一步拖延，增加当事人的诉讼成本和时间成本。
3. 遵循法定程序：当事人在一审、二审程序中享有提出反诉的权利，这是法律赋予当事人的正常诉讼权利。若当事人在一审、二审中没有提出反诉，而选择在再审程序中提出，这显然是对法定诉讼程序的违反。

三、实践操作层面

1. 避免矛盾裁判：在再审案件中，原判决、裁定的内容已经确定。若允许提出反诉，可能导致对同一事实出现相互矛盾的裁判结果，损害司法的权威性和公信力。
2. 遵循法定程序：再审程序有其特定的启动条件和审理范围，不应成为当事人规避正常诉讼程序的手段。若允许在再审中提出反诉，将破坏诉讼程序的连贯性和稳定性。

特殊情况下的处理

在特殊情况下，如原审法院已将本诉与反诉合并审理并作出裁判，且当事人对裁判结果不服申请再审时，反诉作为原审已处理的内容，会在再审程序中一并审查处理。这是为了确保再审的全面性和公正性。

建议与提示

1. 及时行使权利：若当事人希望提出反诉，应在一审法庭辩论终结前提出，以充分利用法律赋予的诉讼权利。
2. 了解再审程序：再审程序是对已生效裁判的再次审理，其目的在于纠正错误，而非为当事人提供新的诉讼机会。因此，当事人在申请再审时，应明确再审请求，避免提出与原审无关的新诉求。
3. 寻求专业帮助：若当事人对再审程序或反诉的提出存在疑问，建议咨询专业律师，以获取更具体、更专业的法律建议。

综上所述，再审程序中一般不允许提起反诉，但存在特定例外情形。当事人在申请再审或提出反诉时，应充分了解相关法律规定和司法实践，以确保自身权益得到有效维护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。