结论：写收条注明“已付清”在特定条件下可以生效，但能否完全替代原补偿款欠条的法律效力，需结合具体情况判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、收条的法律效力
收条的基本作用：
- 收条是证明款项已经实际支付的重要凭证。在离婚补偿款支付完毕后，由收款方出具收条，可以明确表明双方之间的债权债务关系已经终结。
收条的生效条件：
- 收条应当明确、具体地记载收款事项，包括收款人、付款人、收款金额、收款时间以及“已付清”等关键信息。
- 收条应当由收款人亲笔签名或盖章，以确认其真实性。
- 在可能的情况下，收条最好有见证人或第三方在场，以增强其证明力。
二、收条能否替代原欠条
收条与原欠条的关系：
- 原欠条是证明双方存在债权债务关系的原始凭证。
- 收条则是在债权债务关系终结后，由收款方出具的证明款项已支付的凭证。
- 在理想情况下，收条应当与原欠条一起保存，以形成完整的证据链。
收条替代原欠条的可能性：
- 如果收条内容完整、真实，且能够充分证明款项已经支付完毕，那么在一定程度上，收条可以替代原欠条的法律效力。
- 然而，如果收条内容存在瑕疵（如金额不符、签名不真实等），或者存在其他争议（如支付方式、支付时间等），那么仅凭收条可能难以完全证明债权债务关系的终结。
三、建议与注意事项
尽量保存原欠条：
- 尽管收条可以证明款项已支付，但原欠条作为债权债务关系的原始凭证，其证明力更强。因此，在可能的情况下，建议尽量保存原欠条。
完善收条内容：
- 在出具收条时，务必确保内容完整、真实，并明确记载“已付清”等关键信息。如果可能的话，可以附上支付凭证（如银行转账记录、现金收据等）以增强收条的证明力。
考虑其他证据：
- 如果担心收条的证明力不足，可以考虑收集其他相关证据（如聊天记录、录音录像等）来辅助证明款项已支付的事实。
法律咨询：
- 如果在离婚补偿款支付过程中遇到任何法律问题或争议，建议及时咨询专业律师以获取法律帮助。
示例：假设你和前配偶在离婚时约定了一笔补偿款，并出具了欠条。后来，你支付了全部款项，并要求前配偶出具了收条，注明“已收到全部补偿款，已付清”。在这种情况下，如果收条内容真实、完整，且没有其他争议，那么收条可以视为债权债务关系终结的证明。然而，如果前配偶后来反悔或提出其他要求，你可能需要依靠收条以及其他相关证据来维护自己的权益。
最后，如果你在离婚补偿款支付过程中遇到任何具体问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。