供应链公司交保证金是否合法，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度为你详细分析：
一、合法情形
基于合同约定：
- 如果供应链公司与交易对方（如供应商、采购商等）在合同中明确约定了保证金条款，包括保证金的金额、支付方式、退还条件等，且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么这种交保证金的行为是合法的。
- 例如，供应链公司为了确保与供应商的合作稳定，约定在合同签订时支付一定金额的保证金，作为对供应商按时、按质供货的担保。若供应商违约，供应链公司有权扣除部分或全部保证金作为赔偿。
基于行业惯例或交易习惯：
- 在某些特定行业或交易中，交保证金可能是一种普遍接受的交易习惯或行业惯例。如果这种习惯或惯例不违反法律法规，且双方当事人在交易中均予以认可，那么交保证金的行为也是合法的。
- 例如，在国际贸易中，为了确保合同的履行，买方或卖方可能会要求对方支付一定比例的保证金作为履约担保。
二、不合法情形
违反法律法规强制性规定：
- 如果保证金条款违反了法律法规的强制性规定，如《民法典》中关于担保的规定、反不正当竞争法等，那么这种交保证金的行为就是不合法的。
- 例如，如果供应链公司要求供应商支付过高的保证金，且该保证金金额明显超出了合理范围，可能构成对供应商的不公平对待或滥用市场支配地位，从而违反相关法律法规。
存在欺诈、胁迫等情形：
- 如果供应链公司在要求对方交保证金时存在欺诈、胁迫等情形，导致对方在违背真实意愿的情况下支付了保证金，那么这种交保证金的行为也是不合法的。
- 例如，供应链公司以虚假信息诱导供应商支付保证金，或者以威胁、恐吓等手段迫使供应商支付保证金，这些行为都可能构成欺诈或胁迫。
三、法律建议
审查合同条款：
- 在签订涉及保证金的合同时，务必仔细审查合同条款，确保保证金条款合法、合理且明确。
- 特别注意保证金金额、支付方式、退还条件等关键条款，避免模糊不清或存在歧义。
了解行业惯例：
- 在参与特定行业或交易时，了解并尊重行业惯例和交易习惯。
- 如果对行业惯例或交易习惯存在疑问，可以咨询专业律师或相关行业协会以获取准确信息。
保留相关证据：
- 在支付保证金时，务必保留好相关证据，如转账记录、收据、合同等。
- 这些证据在后续可能发生的纠纷中将成为重要的维权依据。
及时咨询律师：
- 如果对保证金条款的合法性或合理性存在疑问，或者在实际操作中遇到了问题，建议及时咨询专业律师。
- 律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和解决方案。
总之，供应链公司交保证金是否合法需根据具体情况来判断。在涉及保证金问题时，务必谨慎对待并咨询专业律师以确保自身权益不受损害。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。