当您的有驾驶证但驾驶无牌电动三轮车运垃圾被交警扣走时，您可以按照以下步骤来处理这一问题，以确保合法取回车辆并避免进一步的法律麻烦：

一、了解扣车原因

首先，您需要明确交警扣车的原因。根据《中华人民共和国道路交通安全法》，上道路行驶的机动车（包括电动三轮车）必须悬挂机动车号牌。因此，交警扣车很可能是因为您的电动三轮车无牌上路。您有权向交警询问具体的扣车原因和所依据的法律法规条款，以确保执法的合法性和合理性。

二、准备相关材料并缴纳罚款

1. 准备材料：

   • 您需要提供有效的身份证明，如身份证，以证明您的身份信息。
   • 购车凭证，如购车发票或收据，以证明车辆的合法来源。
   • 车辆合格证，以证明车辆符合生产标准。

2. 缴纳罚款：

   • 无牌上路可能会面临罚款处罚，具体金额会根据当地交通法规来确定。
   • 您需要前往交通管理部门或指定的银行缴纳罚款，并务必保留好缴费凭证。

三、补办上牌手续

1. 确认车辆类型：

   • 您需要确定您的电动三轮车是否符合当地的上牌标准，这通常涉及车辆的速度、重量、功率等参数。

2. 准备上牌材料：

   • 除了之前提到的身份证明、购车凭证和车辆合格证外，部分地区可能还要求您提供车辆购置税完税证明和交强险保单等。

3. 进行车辆检验：

   • 您需要将电动三轮车开到指定的检测机构进行检验，包括车辆外观、安全性能等方面的检查。

4. 选号和上牌：

   • 检验合格后，您可以前往车管所或相关部门选择车牌号，并领取和安装车牌。

四、取回车辆

在完成缴纳罚款和补办上牌手续后，您可以凭借相关的缴费凭证和手续前往指定的停车场取回被扣押的电动三轮车。在取车时，请确保车辆处于安全状态，并满足所有法定要求。

五、后续建议与预防措施

1. 遵守交通规则：了解并严格遵守当地的交通规则，特别是关于电动车行驶和注册的规定，以避免类似情况再次发生。
2. 及时办理手续：购买电动车后，请尽快办理上牌等必要手续，确保车辆合法上路。
3. 加强安全意识：在骑行电动车时，请佩戴头盔、保持车速适中、注意路况等，以确保自身和他人的安全。

通过遵循以上步骤和建议，您可以合法、有序地处理无牌电动三轮车被扣的情况，并确保车辆的合法性以及自身的权益。同时，遵守交通规则和加强安全意识也是预防类似情况再次发生的关键。